Cellosaurus WA09 (CVCL_9773)
Cell line name | WA09 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | WA 09; WA-09; WA9; H9; H9.hESCs; H9 ESC; H9 hES; H9ES; GE09; WAe003-A; WICELLe003-A; WAe009-A; WA09-PCBC; PCBC02hse2014030502; SC14-067; UKERe008-A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_9773 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: WA09 (RRID:CVCL_9773) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Group: Clinical grade hESC cell line. Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Part of: NHBLI Progenitor Cell Biology Consortium (PCBC) collection. From: University of Wisconsin; Madison; USA. Registration: NIH Human Embryonic Stem Cell Registry; NIHhESC-10-0062. Registration: Swiss research registry; BAG-hES-IMP-0016. Registration: UK Stem Cell Bank (UKSCB); Steering comm. appl. SCSC06-18/SCSC11-06. Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep phosphoproteome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: H2AK5ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2BK12ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2BK15ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H2BK5ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K18ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K23ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K23me2 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K36me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me2 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K56ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K79me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K79me2 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K20me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K5ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K8ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K91ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: Mitochondrial proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Omics: Transcriptome analysis by serial analysis of gene expression (SAGE). Anecdotal: WA01, WA07, WA09, WA13 and WA14 were the first human embryonic stem cells to be established. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=16919167
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Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Blastocyst stage | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Embryonic stem cell | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): PubMed=16919167; PubMed=29246576; WiCell Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/BG02ES_and_H9ES_Myers_protocols.pdf https://strap.nci.nih.gov/celline_detail.php?sample_id=88 https://stemcelldb.nih.gov/cellLineDetails.do?id=13 https://news.wisc.edu/nih-reapproves-wicells-h9-and-three-other-wisconsin-stem-cell-lines-for-federally-funded-research/ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9804556; DOI=10.1126/science.282.5391.1145 PubMed=14745950; DOI=10.1002/dvdy.10431 PubMed=16388305; DOI=10.1038/nbt1177 PubMed=16919167; DOI=10.1186/1741-7007-4-28 PubMed=17570852; DOI=10.1186/gb-2007-8-6-r113 PubMed=17572666; DOI=10.1038/nbt1318 PubMed=20641038; DOI=10.1002/stem.471 PubMed=20736931; DOI=10.1038/mt.2010.179 PubMed=21295703; DOI=10.1016/j.cell.2010.12.032 PubMed=21983960; DOI=10.1038/nmeth.1699 PubMed=21936705; DOI=10.1089/scd.2011.0400 PubMed=22514597; DOI=10.1371/journal.pone.0030743 PubMed=22802639; DOI=10.1073/pnas.1209979109 PubMed=23117585; DOI=10.1016/j.scr.2012.09.002 PubMed=24259714; DOI=10.1073/pnas.1319061110 PubMed=27293150; DOI=10.1016/j.stemcr.2016.05.006 PubMed=27476965; DOI=10.1016/j.stem.2016.06.019 PubMed=27688775; DOI=10.1155/2016/3826249 PubMed=28435121; DOI=10.1016/j.jprot.2017.04.017 PubMed=28445466; DOI=10.1038/nature22312 PubMed=28664172; DOI=10.1016/j.dib.2017.05.036 PubMed=29246576; DOI=10.1016/j.scr.2017.08.004 PubMed=29861859; DOI=10.18632/oncotarget.25353 PubMed=30388422; DOI=10.1016/j.stem.2018.10.009 PubMed=35805069; DOI=10.3390/cells11131984 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | WiCell; wa09
WiCell; wa09-cgmp-material WiCell; wa09-matched-research WiCell; wa09-pcbc | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CCRID; 3101HUMSCSP302
CCRID; 3101HUMSCSP307 hPSCreg; WAe009-A IGRhCellID; H9%20p25-2 IGRhCellID; H9%20p34 ISCR; 89 LINCS_LDP; ES-1001 NIHhESC; NIHhESC-10-0062 SKIP; SKIP001452 SKIP; SKIP001935 TOKU-E; 4223 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0006062 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | 4DN; 4DNSR9WBB58Z
BioSample; SAMN03471903 BioSamples; SAMEA7769668 ENCODE; ENCBS013BRF ENCODE; ENCBS061KRP ENCODE; ENCBS113LZP ENCODE; ENCBS140HIH ENCODE; ENCBS156LDX ENCODE; ENCBS220TZB ENCODE; ENCBS277KDR ENCODE; ENCBS298AAA ENCODE; ENCBS299AAA ENCODE; ENCBS300AAA ENCODE; ENCBS315DEY ENCODE; ENCBS375GFI ENCODE; ENCBS377MXB ENCODE; ENCBS399JWQ ENCODE; ENCBS410BMR ENCODE; ENCBS417MAQ ENCODE; ENCBS477SFO ENCODE; ENCBS485PGF ENCODE; ENCBS532LWE ENCODE; ENCBS616QKE ENCODE; ENCBS656LSW ENCODE; ENCBS692FVF ENCODE; ENCBS703ZDS ENCODE; ENCBS741LLD ENCODE; ENCBS757OPX ENCODE; ENCBS769EPD ENCODE; ENCBS808UWK ENCODE; ENCBS853WXF ENCODE; ENCBS883RFB ENCODE; ENCBS996IWU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q27555433 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM239975
GEO; GSM288333 GEO; GSM288335 GEO; GSM288397 GEO; GSM347923 GEO; GSM383878 GEO; GSM383879 GEO; GSM384100 GEO; GSM500936 GEO; GSM579901 GEO; GSM579902 GEO; GSM569191 GEO; GSM569192 GEO; GSM603054 GEO; GSM603055 GEO; GSM605307 GEO; GSM605310 GEO; GSM605314 GEO; GSM605316 GEO; GSM605324 GEO; GSM616127 GEO; GSM616128 GEO; GSM616129 GEO; GSM627785 GEO; GSM637777 GEO; GSM665037 GEO; GSM667608 GEO; GSM667609 GEO; GSM667610 GEO; GSM667611 GEO; GSM667612 GEO; GSM667613 GEO; GSM667616 GEO; GSM667619 GEO; GSM667620 GEO; GSM667621 GEO; GSM667622 GEO; GSM667623 GEO; GSM667625 GEO; GSM667626 GEO; GSM667628 GEO; GSM667629 GEO; GSM667630 GEO; GSM667631 GEO; GSM667632 GEO; GSM667633 GEO; GSM667634 GEO; GSM667635 GEO; GSM667636 GEO; GSM667637 GEO; GSM667638 GEO; GSM667639 GEO; GSM667640 GEO; GSM667643 GEO; GSM669899 GEO; GSM669901 GEO; GSM670053 GEO; GSM674603 GEO; GSM706044 GEO; GSM706059 GEO; GSM706060 GEO; GSM706061 GEO; GSM706062 GEO; GSM706063 GEO; GSM706064 GEO; GSM706066 GEO; GSM706071 GEO; GSM706076 GEO; GSM755488 GEO; GSM755491 GEO; GSM816629 GEO; GSM856731 GEO; GSM860961 GEO; GSM860962 GEO; GSM860963 GEO; GSM862733 GEO; GSM927236 GEO; GSM997555 GEO; GSM997556 GEO; GSM997557 GEO; GSM1040243 GEO; GSM1040313 GEO; GSM1084832 GEO; GSM1084835 GEO; GSM1084943 GEO; GSM1084944 GEO; GSM1084992 GEO; GSM1085015 GEO; GSM1215278 GEO; GSM1215279 GEO; GSM1227088 GEO; GSM1489249 GEO; GSM1489460 GEO; GSM1589800 GEO; GSM1589812 GEO; GSM1589932 GEO; GSM1589944 GEO; GSM1658377 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD003903
PRIDE; PXD006271 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 06-Jun-2012 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 21-Mar-2023 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |