Cellosaurus AGS (CVCL_0139)
Cell line name | AGS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Accession | CVCL_0139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: AGS (RRID:CVCL_0139) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: FGFR genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1034). Part of: JFCR45 cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Part of: PI3K genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1028). Population: Caucasian. Virology: Persistently infected with parainfluenza virus type 5 (PIV5) strain PIV5-AGS (PubMed=17509637; PubMed=27445371). Doubling time: 24 hours (PubMed=1370612); 22 hours (PubMed=25984343); 20 hours (PubMed=29435981); 24.16 +- 0.07 hours (PubMed=35122114); ~20 hours (ATCC=CRL-1739). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Genomics; ChIP-seq; GATA4. Omics: Genomics; ChIP-seq; GATA6. Omics: Genomics; ChIP-seq; KLF5. Omics: Genomics; DNA methylation analysis. Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Phenotyping; CRISPR screening. Omics: Phenotyping; Drug screening. Omics: Phenotyping; shRNA library screening. Omics: Proteomics; Expression; Reverse-phase protein array. Omics: Proteomics; Quantitative. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; SNP array analysis. Derived from site: In situ; Stomach; UBERON=UBERON_0000945. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Gastric adenocarcinoma (NCIt: C4004) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 54Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio=C0023004/4958; ATCC=CRL-1739; BCRC=60102; CCRID; CLS=300408; Cosmic-CLP=906790; ECACC=89090402; IZSLER=BS TCL 135; KCLB=21739; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | Info; MCLP; -; https://tcpaportal.org/mclp/ Provider; Altogen; Xenograft model; https://altogenlabs.com/xenograft-models/gastric-xenograft-model/ags-xenograft-model/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6831414 PubMed=1370612; DOI=10.1016/S0006-291X(05)80133-0 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50014-9 PubMed=10402490; DOI=10.3892/ijmm.4.2.203 PubMed=15767549; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-04-0234 PubMed=17509637; DOI=10.1016/j.virol.2007.03.061 PubMed=18804159; DOI=10.1016/j.ygeno.2008.08.002 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=24807215; DOI=10.1038/ncomms4830; PMCID=PMC4024760 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35; PMCID=PMC4432652 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=27445371; DOI=10.1128/genomeA.00653-16; PMCID=PMC4956444 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=29435981; DOI=10.1002/ijc.31304 PubMed=29717028; DOI=10.1042/BSR20180277; PMCID=PMC6050193 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 DOI=10.21203/rs.3.rs-1302156/v1 PubMed=35122114; DOI=10.1007/s00210-022-02217-3 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | AddexBio; C0023004/4958
ATCC; CRL-1739 BCRC; 60102 BCRJ; 0311 CCTCC; GDC0247 CLS; 300408 ECACC; 89090402 IBRC; C10071 IZSLER; BS TCL 135 KCB; KCB 200708YJ KCLB; 21739 NCBI_Iran; C131 Ubigene; YC-C003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0001686
MCCL; MCC:0000032 CLDB; cl258 CLDB; cl5134 cancercelllines; CVCL_0139 CCRID; 1101HUM-PUMC000480 CCRID; 3101HUMTCHu232 CCRID; 4201HUM-CCTCC00247 Cell_Model_Passport; SIDM00850 Cosmic-CLP; 906790 DepMap; ACH-000880 IGRhCellID; AGS LINCS_HMS; 50004 LINCS_LDP; LCL-1893 Lonza; 727 TOKU-E; 522 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0001007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471028
BioSample; SAMN03471416 BioSample; SAMN10988305 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308078
ChEMBL-Targets; CHEMBL613860 GDSC; 906790 PharmacoDB; AGS_56_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54748713 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002109 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
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Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 685586
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Proteomic databases | PRIDE; PXD000722
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
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Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 48 |