Cellosaurus (CVCL_L507)
| Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: African American. Characteristics: Established from a nude mice xenograft. Doubling time: ~60 hours (CLS=300464); ~60-70 hours (DSMZ=ACC-182). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Genomics; DNA methylation analysis. Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Phenotyping; CRISPR screening. Omics: Phenotyping; Drug screening. Omics: Proteomics; Quantitative. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; SNP array analysis. Derived from site: In situ; Esophagus; UBERON=UBERON_0001043. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HLA typing | Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disease | Esophageal squamous cell carcinoma (NCIt: C4024) Squamous cell carcinoma of the esophagus (ORDO: Orphanet_99977) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Age at sampling | 57Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STR profile | Source(s): CLS=300464; Cosmic-CLP=906817; DSMZ=ACC-182; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Publications |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell line collections (Providers) | CLS; 300464
DSMZ; ACC-182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_1131
Cell_Model_Passport; SIDM00956 Cosmic-CLP; 906817 DepMap; ACH-000717 DSMZCellDive; ACC-182 LINCS_LDP; LCL-1551 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological sample resources | BioSample; SAMN10988482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308724
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075427 GDSC; 906817 PharmacoDB; COLO680N_228_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Encyclopedic resources | Wikidata; Q54814135 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene expression databases | GEO; GSM827548
GEO; GSM886945 GEO; GSM888012 GEO; GSM1669689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 906817
IARC_TP53; 21236 LiGeA; CCLE_092 Progenetix; CVCL_1131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Version number | 40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||