Cellosaurus LIM1215 (CVCL_2574)
Cell line name | LIM1215 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Lim1215; LIM 1215; LIM-1215 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: LIM1215 (RRID:CVCL_2574) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. From: Ludwig Institute for Cancer Research, Melbourne Branch; Melbourne; Australia. Population: Caucasian. Doubling time: 32 hours (Note=At 8th passage) (PubMed=3857372); 28 hours (PubMed=1427983); 29.52 hours (PubMed=25944804). Microsatellite instability: Instable (MSI) (PubMed=19378335; PubMed=24755471; PubMed=25926053). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative phosphoproteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: N-glycan profiling. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Omentum; UBERON=UBERON_0003688. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Colon adenocarcinoma (NCIt: C4349) Lynch syndrome (NCIt: C8494) Lynch syndrome (ORDO: Orphanet_144) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 34Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): CBA=CBA-0161; PubMed=11416159; PubMed=25926053 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=3857372; DOI=10.1093/jnci/74.4.759 PubMed=1427983; DOI=10.1038/icb.1992.30 PubMed=9328464; DOI=10.1093/hmg/6.12.2011 PubMed=9515795 PubMed=11416159; DOI=10.1073/pnas.121616198; PMCID=PMC35459 PubMed=12615714 PubMed=19378335; DOI=10.1002/ijc.24289 PubMed=20570890; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-10-0192; PMCID=PMC2943514 PubMed=22722830; DOI=10.1038/nature11156; PMCID=PMC3927413 PubMed=23458625; DOI=10.1021/pr3010869 PubMed=24295106; DOI=10.1021/pr400861m PubMed=24755471; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-14-0013 PubMed=25623215; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-14-2821 PubMed=25926053; DOI=10.1038/ncomms8002 PubMed=25944804; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-14-2457 PubMed=28854368; DOI=10.1016/j.celrep.2017.08.010; PMCID=PMC5583477 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | CBA; CBA-0161
ECACC; 10092301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_2574
Cell_Model_Passport; SIDM00014 ColonAtlas; LIM1215 Cosmic-CLP; 2162949 DepMap; ACH-001546 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0001916 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN07624413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 869795
GDSC; 2162949 PharmacoDB; LIM1215_836_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54902517 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0022437 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM741246
GEO; GSM1346878 GEO; GSM1448118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 869795
Cosmic; 1184335 Cosmic; 1238050 Cosmic; 1479632 Cosmic; 1482515 Cosmic; 1486135 Cosmic; 1524335 Cosmic; 1676746 Cosmic; 1805257 Cosmic; 2301991 Cosmic; 2667967 Cosmic; 2787550 Cosmic; 2841366 IARC_TP53; 22464 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD000120
PRIDE; PXD005235 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |