Cellosaurus NCI-N87 (CVCL_1603)
Cell line name | NCI-N87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | NCI N87; N87; N-87; NCI-H87; H87; H-87; NCIN87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: NCI-N87 (RRID:CVCL_1603) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MET genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1036). Characteristics: Established from a nude mouse xenograft. Doubling time: 47 hours (PubMed=2158397); 86 hours (PubMed=25984343); 23 hours (PubMed=26919099); 47 hours (PubMed=29435981). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Genomics; DNA methylation analysis. Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Phenotyping; CRISPR screening. Omics: Phenotyping; Drug screening. Omics: Phenotyping; shRNA library screening. Omics: Proteomics; Quantitative. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; SNP array analysis. Caution: According to PubMed=1676761 the ethnicity of the donor is Caucasian, but exome analysis finds it to be mostly of African lineage. Misspelling: NU-N87; BioSample=SAMN01120666; PubMed=25960936; Note=Also in all the NCBI data records associated with the BioSample record. Derived from site: Metastatic; Liver; UBERON=UBERON_0002107. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Gastric tubular adenocarcinoma (NCIt: C5473) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Age unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio=C0023002/4674; ATCC=CRL-5822; CCRID; Cosmic-CLP=908461; PubMed=25877200; PubMed=27102572; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | Info; ATCC; -; https://www.atcc.org/en/support/technical-support/faqs/normal-morphology-and-growth-of-crl-5822-cells Provider; Altogen; Xenograft model; https://altogenlabs.com/xenograft-models/gastric-xenograft-model/nci-n87-xenograft-model/ Provider; BRICS; BRICS0122; http://www.brics.ac.cn/cell/template/cell/cell_detail.html?id=3925 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2158397 PubMed=1676761; DOI=10.1093/jnci/83.13.938 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50014-9 PubMed=8806089; DOI=10.1002/jcb.240630502 PubMed=8806092; DOI=10.1002/jcb.240630505 PubMed=8806095; DOI=10.1002/jcb.240630508 PubMed=18804159; DOI=10.1016/j.ygeno.2008.08.002 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=24807215; DOI=10.1038/ncomms4830; PMCID=PMC4024760 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35; PMCID=PMC4432652 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=26919099; DOI=10.18632/oncotarget.7575; PMCID=PMC4951299 PubMed=27102572; DOI=10.1002/path.4729; PMCID=PMC4922416 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=29435981; DOI=10.1002/ijc.31304 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564; PMCID=PMC7496084 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | AddexBio; C0023002/4674
ATCC; CRL-5822 BCRC; 60217 BCRJ; 0350 CCTCC; GDC0256 CLS; 305057 IZSLER; BS TCL 224 KCB; KCB 2010183YJ KCLB; 60113 KCLB; 60187 - Discontinued Ubigene; YC-C068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008129
cancercelllines; CVCL_1603 CCRID; 1101HUM-PUMC000481 CCRID; 3101HUMSCSP534 CCRID; 3101HUMTCHu130 CCRID; 4201HUM-CCTCC00256 Cell_Model_Passport; SIDM01147 Cosmic-CLP; 908461 DepMap; ACH-000427 LINCS_LDP; LCL-1886 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0003053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01120666
BioSample; SAMN03473211 BioSample; SAMN10987913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307326
ChEMBL-Targets; CHEMBL614197 GDSC; 908461 PharmacoDB; NCIN87_1151_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54908217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002841 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM267420 GEO; GSM267427 GEO; GSM267434 GEO; GSM267441 GEO; GSM552366 GEO; GSM562405 GEO; GSM827404 GEO; GSM828827 GEO; GSM844665 GEO; GSM887453 GEO; GSM888533 GEO; GSM1237678 GEO; GSM1237703 GEO; GSM1374768 GEO; GSM1374769 GEO; GSM1374770 GEO; GSM1670272 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 685598
Cosmic; 687556 Cosmic; 868236 Cosmic; 887250 Cosmic; 908461 Cosmic; 1187286 Cosmic; 1482074 Cosmic; 1582431 Cosmic; 1995594 Cosmic; 2036661 Cosmic; 2069775 Cosmic; 2443800 Cosmic; 2484955 Cosmic; 2807636 Cosmic; 2823228 IARC_TP53; 305 LiGeA; CCLE_561 Progenetix; CVCL_1603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 51 |