Cellosaurus (CVCL_B5EA)
| Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: JWGray breast cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Asian. Doubling time: ~70 hours (DSMZ=ACC-440); 99.85 hours (JWGray panel). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Genomics; DNA methylation analysis. Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Phenotyping; Drug screening. Omics: Proteomics; Expression; Reverse-phase protein array. Omics: Proteomics; Quantitative. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; SNP array analysis. Derived from site: In situ; Breast; UBERON=UBERON_0000310. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HLA typing | Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disease | Breast carcinoma (NCIt: C4872) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species of origin | Carassius auratus (Goldfish) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Originate from same individual | CVCL_B7MJ ! CAL-85-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Age at sampling | 35Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=910852; DSMZ=ACC-440; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Web pages | Info; MCLP; -; https://tcpaportal.org/mclp/ Info; Synapse; JWGray panel; https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2346643/wiki/62255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Publications |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell line databases/resources | Cosmic-CLP; 910852
DepMap; ACH-000857 DSMZCellDive; ACC-440 LINCS_HMS; 51112 LINCS_LDP; LCL-1465 Lonza; 1212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308700
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075415 GDSC; 910852 PharmacoDB; CAL851_177_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Encyclopedic resources | Wikidata; Q54808414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene expression databases | GEO; GSM274639
GEO; GSM344363 GEO; GSM344413 GEO; GSM827163 GEO; GSM843484 GEO; GSM843485 GEO; GSM847247 GEO; GSM847457 GEO; GSM886913 GEO; GSM887979 GEO; GSM1172947 GEO; GSM1669657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 910852
Cosmic; 2164987 IARC_TP53; 21215 LiGeA; CCLE_496 Progenetix; CVCL_1114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Version number | 42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||