Cellosaurus SW527 (CVCL_3799)
Cell line name | SW527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SW-527; SW 527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SW527 (RRID:CVCL_3799) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a SW480 derivative (PubMed=288927; PubMed=20143388). Originally thought to originate from a 70 year old female patient with a metastatic breast carcinoma. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: Naval Biosciences Laboratory (NBL) collection (transferred to ATCC in 1982). From: Scott and White Clinic; Temple; USA. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00089. Population: Caucasian. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from sampling site: Colon. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Colon adenocarcinoma (NCIt: C4349) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0546 (SW480) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 51Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; DepMap; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://dpsc.ccbr.utoronto.ca/cancer/get_cellline.pl?cellline=SW527 https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v12_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=288927; DOI=10.1093/jnci/63.3.635 PubMed=20143388; DOI=10.1002/ijc.25242 PubMed=22585861; DOI=10.1158/2159-8290.CD-11-0224 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25892236; DOI=10.1016/j.celrep.2015.03.050 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | ATCC; CRL-7940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009219
DepMap; ACH-001825 LINCS_HMS; 50046 LINCS_LDP; LCL-1474 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03151930
BioSample; SAMN03481115 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; SW527_1526_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54971177 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0005462 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1047713 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD008222 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 21-Mar-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 29 |