Cellosaurus RKO-E6 (CVCL_3787)
Cell line name | RKO-E6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | RKOE6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: RKO-E6 (RRID:CVCL_3787) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Transfected with: UniProtKB; P03126; Human papillomavirus type 16 protein E6. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Colon carcinoma (NCIt: C4910) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0504 (RKO) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Sex unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Age unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8387205; DOI=10.1073/pnas.90.9.3988 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | ATCC; CRL-2578
CLS; 305135 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008827
CCRID; 3101HUMTCHu118 Cell_Model_Passport; SIDM01253 ColonAtlas; RKOE6 IGRhCellID; RKOE6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471683
BioSample; SAMN03472970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; RKOE6_1317_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54950558 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1184102
Cosmic; 1187317 Progenetix; CVCL_3787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 21-Mar-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 24 |