Cellosaurus RKO-E6 (CVCL_3787)
| Cell line name | RKO-E6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Synonyms | RKO E6; RKOE6; RC10-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Accession | CVCL_3787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: RKO-E6 (RRID:CVCL_3787) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments | Genetic integration: Method=Transfection; Gene=UniProtKB; P03126; Human papillomavirus type 16 protein E6. Genetic integration: Method=Transfection; Gene=UniProtKB; P00552; Klebsiella pneumoniae transposon Tn5 neo. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; SNP array analysis. Caution: We believe that the clone called RKO-E6 by PubMed=7700629 is the clone RC10-1 originally described by PubMed=8387205 but it is also possible that it is RKO RC10-2 (Cellosaurus=CVCL_E7ET) or RKO RC10-3 (Cellosaurus=CVCL_E7EU) or RKO RC10-4 (Cellosaurus=CVCL_E7EV). Derived from site: In situ; Colon; UBERON=UBERON_0001155. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence variations |
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| HLA typing | Source: PubMed=26589293
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| Disease | Colon carcinoma (NCIt: C4910) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Hierarchy | Parent: CVCL_0504 (RKO) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sex of cell | Sex unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Age at sampling | Age unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2578; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Publications | PubMed=8387205; DOI=10.1073/pnas.90.9.3988; PMCID=PMC46431 PubMed=8202487; DOI=10.1073/pnas.91.12.5320; PMCID=PMC43986 PubMed=7700629 PubMed=15161374; DOI=10.1667/rr3160 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2578
CLS; 305135 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008827
cancercelllines; CVCL_3787 CCRID; 3101HUMTCHu118 Cell_Model_Passport; SIDM01253 ColonAtlas; RKOE6 IGRhCellID; RKOE6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0001891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological sample resources | BioSample; SAMN03471683
BioSample; SAMN03472970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemistry resources | PharmacoDB; RKOE6_1317_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Encyclopedic resources | Wikidata; Q54950558 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental variables resources | EFO; EFO_0002318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1184102
Cosmic; 1187317 Progenetix; CVCL_3787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Last entry update | 14-Aug-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Version number | 30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||