Cellosaurus BJ [Human fibroblast] (CVCL_3653)
Cell line name | BJ [Human fibroblast] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | FF-WT-BJ; BJ1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3653 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: BJ [Human fibroblast] (RRID:CVCL_3653) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Senescence: Senesces at 72 PDL. Has a long lifespan in comparison with other normal human fibroblast cell lines (ATCC=CRL-2522). Omics: CTCF ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K36me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from sampling site: Foreskin; skin. Cell type=Fibroblast. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | <1M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Finite cell line | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; PubMed=29444910 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://strap.nci.nih.gov/celline_detail.php?sample_id=67 http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/BJ_Stam_protocol.pdf | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=12554677; DOI=10.1093/hmg/ddg023 PubMed=23325432; DOI=10.1101/gr.147942.112 PubMed=29444910; DOI=10.1530/ERC-17-0445 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | AddexBio; P0012005/4972
ATCC; CRL-2522 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0001980
Cell_Model_Passport; SIDM01891 Lonza; 723 SKIP; SKIP001154 TOKU-E; 672 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0003807 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | ENCODE; ENCBS070WLP
ENCODE; ENCBS074ENC ENCODE; ENCBS137RRI ENCODE; ENCBS170GUW ENCODE; ENCBS198NMJ ENCODE; ENCBS335XLL ENCODE; ENCBS339MSO ENCODE; ENCBS488ZLU ENCODE; ENCBS610AAA ENCODE; ENCBS611AAA ENCODE; ENCBS612AAA ENCODE; ENCBS613AAA ENCODE; ENCBS614AAA ENCODE; ENCBS615AAA ENCODE; ENCBS616AAA ENCODE; ENCBS628EGC ENCODE; ENCBS683XYV ENCODE; ENCBS693PNC ENCODE; ENCBS753AAA ENCODE; ENCBS754AAA ENCODE; ENCBS772THG ENCODE; ENCBS815JWZ ENCODE; ENCBS911DVL ENCODE; ENCBS935PZD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307781
ChEMBL-Targets; CHEMBL614358 PubChem_Cell_line; CVCL_3653 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54796903 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002779 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM248213
GEO; GSM248214 GEO; GSM472898 GEO; GSM472924 GEO; GSM472925 GEO; GSM579886 GEO; GSM579887 GEO; GSM736518 GEO; GSM736596 GEO; GSM749677 GEO; GSM749752 GEO; GSM749770 GEO; GSM923444 GEO; GSM945178 GEO; GSM945204 GEO; GSM945207 GEO; GSM945235 GEO; GSM2988896 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 21-Mar-2023 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 28 |