Cellosaurus IM95 (CVCL_2961)
Cell line name | IM95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Im95; IM-95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: IM95 (RRID:CVCL_2961) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Japanese. Doubling time: 25 hours (PubMed=14609362); ~1.2 days (lot 11162005), ~46 hours (lot 10132009), ~35 hours (lot 09302016) (JCRB). Microsatellite instability: Instable (MSI-low) (PubMed=31068700; Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from sampling site: Stomach. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Gastric adenocarcinoma (NCIt: C4004) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 63Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; JCRB; PubMed=25877200 Markers:
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Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=14609362; DOI=10.1290/1543-706X(2003)039<0288:COACCH>2.0.CO;2 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=24807215; DOI=10.1038/ncomms4830 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | JCRB; JCRB1075.0
JCRB; NIHS0333 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | Cell_Model_Passport; SIDM00602
Cosmic-CLP; 1240155 DepMap; ACH-000919 LINCS_LDP; LCL-1884 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005908 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470904
BioSample; SAMN10988365 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4295463
ChEMBL-Targets; CHEMBL4296441 GDSC; 1240155 PharmacoDB; IM95_657_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_2961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54897510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM552360 GEO; GSM562403 GEO; GSM827403 GEO; GSM844571 GEO; GSM887161 GEO; GSM888233 GEO; GSM1237675 GEO; GSM1237700 GEO; GSM1374573 GEO; GSM1669933 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1187278
Cosmic; 1482079 Cosmic; 1995455 Cosmic; 2443798 IARC_TP53; 30079 LiGeA; CCLE_708 Progenetix; CVCL_2961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 21-Mar-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 30 |