Cellosaurus ATRFLOX (CVCL_2299)
| Cell line name | ATRFLOX | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Synonyms | ATRFLOX [Mutatect]; ATRflox/- | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Accession | CVCL_2299 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: ATRFLOX (RRID:CVCL_2299) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments | Population: Caucasian. Characteristics: One copy of the ATR gene has been disrupted while lox sites have been added flanking exon 2 of the 2nd allele thus making it susceptible to Cre-mediated deletion. Knockout cell: Method=Homologous recombination; HGNC; HGNC:882; ATR (Note=1 of 2 alleles). Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; SNP array analysis. Derived from site: In situ; Colon; UBERON=UBERON_0001155. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence variations |
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| HLA typing | Source: PubMed=26589293
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| Disease | Colon carcinoma (NCIt: C4910) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Hierarchy | Parent: CVCL_0291 (HCT 116) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Age at sampling | 48Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2780; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Publications | PubMed=11721054; DOI=10.1126/science.1065521 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2780 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell line databases/resources | CLO; CLO_0001764
cancercelllines; CVCL_2299 ColonAtlas; ATRFLOX | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological sample resources | BioSample; SAMN03472971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemistry resources | PharmacoDB; ATRFLOX_69_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Encyclopedic resources | Wikidata; Q54751289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental variables resources | EFO; EFO_0006535 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Version number | 30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||