Cellosaurus ATRFLOX (CVCL_2299)
Cell line name | ATRFLOX | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | ATRFLOX [Mutatect]; ATRflox/- | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2299 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: ATRFLOX (RRID:CVCL_2299) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Population: Caucasian. Characteristics: One copy of the ATR gene has been disrupted while lox sites have been added flanking exon 2 of the 2nd allele thus making it susceptible to Cre-mediated deletion. Knockout cell: Method=Homologous recombination; HGNC; 882; ATR (Note=1 of 2 alleles). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Colon; UBERON=UBERON_0001155. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Colon carcinoma (NCIt: C4910) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0291 (HCT 116) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 48Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=11721054; DOI=10.1126/science.1065521 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2780 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0001764
cancercelllines; CVCL_2299 ColonAtlas; ATRFLOX | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; ATRFLOX_69_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54751289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006535 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 30-Jan-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 27 |