Cellosaurus HCC33 (CVCL_2058)
Cell line name | HCC33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HCC-33; HCC0033; Hamon Cancer Center 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCC33 (RRID:CVCL_2058) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: ~40 hours (DSMZ=ACC-487). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Genomics; DNA methylation analysis. Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Phenotyping; Drug screening. Omics: Proteomics; Expression; Reverse-phase protein array. Omics: Proteomics; Quantitative. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; SNP array analysis. Miscellaneous: Direct author submission of STR profile from Girard, Luc and Gazdar, Adi F. Derived from site: Metastatic; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung small cell carcinoma (NCIt: C4917) Small cell lung cancer (ORDO: Orphanet_70573) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_L063 ! HCC33 BL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 52Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1303901; Direct_author_submission; DSMZ=ACC-487; PubMed=20679594; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | Provider; UT Southwestern; -; https://www.utsouthwestern.edu/edumedia/edufiles/about_us/admin_offices/technology_development/available_technologies/cell-lines.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9559342; DOI=10.1002/(SICI)1098-2264(199804)21:4<308::AID-GCC4>3.0.CO;2-2 PubMed=10987304 PubMed=11314036; DOI=10.1038/sj.onc.1204211 PubMed=19472407; DOI=10.1002/humu.21028; PMCID=PMC2900846 PubMed=20557307; DOI=10.1111/j.1349-7006.2010.01622.x; PMCID=PMC11158680 PubMed=20679594; DOI=10.1093/jnci/djq279; PMCID=PMC2935474 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=22961666; DOI=10.1158/2159-8290.CD-12-0112; PMCID=PMC3567922 PubMed=23716474; DOI=10.1002/gcc.22076; PMCID=PMC3806277 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564; PMCID=PMC7496084 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-487
KCLB; 70033 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0010000
cancercelllines; CVCL_2058 Cell_Model_Passport; SIDM01071 Cosmic-CLP; 1303901 DepMap; ACH-000515 DSMZCellDive; ACC-487 LINCS_LDP; LCL-1833 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0006529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473100
BioSample; SAMN10987702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1303901
PharmacoDB; HCC33_457_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54881692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006417 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM171904 GEO; GSM171905 GEO; GSM794373 GEO; GSM887052 GEO; GSM888122 GEO; GSM1669857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 877235
Cosmic; 1219093 Cosmic; 1239927 Cosmic; 1320184 Cosmic; 1518101 Cosmic; 2125212 IARC_TP53; 28312 LiGeA; CCLE_798 Progenetix; CVCL_2058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 44 |