Cellosaurus CAL-78 (CVCL_1809)
Cell line name | CAL-78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | CAL 78; CAL78; Centre Antoine Lacassagne-78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1809 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CAL-78 (RRID:CVCL_1809) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Doubling time: 60 hours, at 15th passage (PubMed=21590123); ~240 hours (DSMZ=ACC-449). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from sampling site: Thigh; skeletal muscle. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Dedifferentiated chondrosarcoma (NCIt: C6476) Chondrosarcoma (ORDO: Orphanet_55880) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 76Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; DSMZ Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=21590123; DOI=10.3892/or.4.4.697 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-449 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002189
Cell_Model_Passport; SIDM00929 Cosmic-CLP; 1290765 DepMap; ACH-000516 DSMZCellDive; ACC-449 LINCS_LDP; LCL-1457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473549
BioSample; SAMN10988508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1290765
PharmacoDB; CAL78_176_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54808413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM886912 GEO; GSM887978 GEO; GSM1669656 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1995359
IARC_TP53; 28271 LiGeA; CCLE_364 Progenetix; CVCL_1809 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 21-Mar-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 30 |