Cellosaurus NB69 (CVCL_1448)
Cell line name | NB69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | NB-69; NB_69; NB 69; NB69-RIKEN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: NB69 (RRID:CVCL_1448) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Chromatin accessibility by ATAC-seq. Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Neuroblastoma (NCIt: C3270) Neuroblastoma (ORDO: Orphanet_635) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 1Y4M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=908440; ECACC=99072802; PubMed=25877200; RCB=RCB0480 Markers:
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Publications | DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50006-X DOI=10.1007/0-306-46872-7_2 PubMed=16822308; DOI=10.1186/1471-2407-6-177; PMCID=PMC1533846 PubMed=18923524; DOI=10.1038/nature07399 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=23202128; DOI=10.1038/ng.2493; PMCID=PMC3557959 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28350380; DOI=10.1038/sdata.2017.33; PMCID=PMC5369315 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ECACC; 99072802
RCB; RCB0480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0050263
cancercelllines; CVCL_1448 Cell_Model_Passport; SIDM00244 Cosmic-CLP; 908440 DepMap; ACH-002083 LINCS_LDP; LCL-1999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005426 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308799
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075510 GDSC; 908440 PharmacoDB; NB69_993_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54907543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM313807 GEO; GSM563353 GEO; GSM827391 GEO; GSM1670154 GEO; GSM2371245 GEO; GSM2394385 GEO; GSM3145725 GEO; GSM4104585 GEO; GSM4104586 GEO; GSM4104632 GEO; GSM4104633 GEO; GSM4104634 GEO; GSM4105323 GEO; GSM4105324 GEO; GSM4105325 GEO; GSM4105326 GEO; GSM4105327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 688081
Cosmic; 801739 Cosmic; 908440 Cosmic; 920248 Cosmic; 930069 Cosmic; 947709 Cosmic; 1019930 Cosmic; 1037342 Cosmic; 1099139 Cosmic; 1109123 Cosmic; 1153787 Cosmic; 1890119 Cosmic; 2058110 Cosmic; 2131577 IARC_TP53; 21531 IARC_TP53; 27184 Progenetix; CVCL_1448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |