Cellosaurus H-EMC-SS (CVCL_1238)
| Cell line name | H-EMC-SS | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Synonyms | HEMCSS; HEMC-SS | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Accession | CVCL_1238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: H-EMC-SS (RRID:CVCL_1238) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Doubling time: 17.3-42.8 hours (CelloPub=CLPUB00044). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Genomics; DNA methylation analysis. Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Phenotyping; Drug screening. Omics: Proteomics; Quantitative. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Variations; SNP array analysis. Caution: Does not harbor a gene fusion involving EWSR1 which is a hallmark of extraskeletal myxoid chondrosarcoma (PubMed=34413129). Derived from site: In situ; Muscle; UBERON=UBERON_0001630. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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| Disease | Extraskeletal myxoid chondrosarcoma (NCIt: C27502) Extraskeletal myxoid chondrosarcoma (ORDO: Orphanet_209916) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Age at sampling | 77Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=907290; DepMap=ACH-001519; RCB=RCB0508 Markers:
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| Publications | CLPUB00044 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=34413129; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-21-0089; PMCID=PMC8571037 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell line collections (Providers) | ECACC; 94042258
ICLC; HTL99016 RCB; RCB0508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003701
CLO; CLO_0051381 CLDB; cl1625 CLDB; cl4965 cancercelllines; CVCL_1238 Cell_Model_Passport; SIDM00535 Cosmic-CLP; 907290 DepMap; ACH-001519 LINCS_LDP; LCL-1458 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological sample resources | BioSample; SAMD00005690
BioSample; SAMN03472276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308736
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075451 GDSC; 907290 PharmacoDB; HEMCSS_419_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Encyclopedic resources | Wikidata; Q54871889 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 FANTOM5_SSTAR; 10410-106B5 GEO; GSM827448 GEO; GSM1669877 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 907290
IARC_TP53; 21353 Progenetix; CVCL_1238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Version number | 36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||