Cellosaurus DBTRG-05MG (CVCL_1169)
Cell line name | DBTRG-05MG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | DBTRG.05MG; DBTRG05MG; DBTRG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: DBTRG-05MG (RRID:CVCL_1169) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: 54 hours (PubMed=25984343); ~48 hours (DSMZ=ACC-359). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: shRNA library screening. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Brain; UBERON=UBERON_0000955. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Anaplastic astrocytoma (NCIt: C9477) Anaplastic astrocytoma (ORDO: Orphanet_251589) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 59Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2020; Cosmic-CLP=906835; DepMap=ACH-000863; DSMZ=ACC-359; ECACC=93061119 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | DOI=10.1007/0-306-46861-1_11 PubMed=11668190; DOI=10.1177/002215540104901105 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35; PMCID=PMC4432652 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2020
BCRC; 60380 DSMZ; ACC-359 ECACC; 93061119 ICLC; HTL98001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002722
CLO; CLO_0002723 CLDB; cl1005 CLDB; cl1006 cancercelllines; CVCL_1169 Cell_Model_Passport; SIDM00867 Cosmic-CLP; 906835 DepMap; ACH-000863 DSMZCellDive; ACC-359 IGRhCellID; DBTRG05MG LINCS_LDP; LCL-1349 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471277
BioSample; SAMN03473317 BioSample; SAMN10988246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 855 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308485
ChEMBL-Targets; CHEMBL614801 GDSC; 906835 PharmacoDB; DBTRG05MG_285_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54828614 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002159 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM326248 GEO; GSM886974 GEO; GSM888043 GEO; GSM1669728 GEO; GSM5087478 GEO; GSM5087479 GEO; GSM5087480 GEO; GSM5087481 GEO; GSM5087482 GEO; GSM5087483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 685871
Cosmic; 850827 Cosmic; 906835 Cosmic; 1746961 Cosmic; 2302326 Cosmic; 2367523 Cosmic; 2516015 IARC_TP53; 21300 LiGeA; CCLE_313 Progenetix; CVCL_1169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD022868
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 40 |