Cellosaurus SK-N-SH (CVCL_0531)
Cell line name | SK-N-SH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SK N SH; SKN-SH; SK-NSH; SKNSH; NSH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SK-N-SH (RRID:CVCL_0531) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. From: Memorial Sloan Kettering Cancer Center; New York; USA. Registration: Memorial Sloan Kettering Cancer Center Office of Technology Development; SK1980-529. Population: Caucasian. Doubling time: 44 hours (PubMed=4748425). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Genomics; ChIP-seq. Omics: Genomics; Chromatin accessibility; ATAC-seq. Omics: Genomics; DNA methylation analysis. Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Phenotyping; CRISPR screening. Omics: Phenotyping; Drug screening. Omics: Proteomics; Quantitative. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; Array-based CGH. Omics: Variations; SNP array analysis. Misspelling: SK-N-CH; Note=Occasionally. Derived from site: Metastatic; Bone marrow; UBERON=UBERON_0002371. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Neuroblastoma (NCIt: C3270) Neuroblastoma (ORDO: Orphanet_635) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 4Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio=C0005006/4924; ATCC=HTB-11; CCRID; Cosmic-CLP=717431; ECACC=86012802; KCLB=30011; PubMed=25877200; RCB=RCB0426; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | Info; ENCODE; -; http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/SK-N-SH_Myers_protocol.pdf Info; Thermo Fisher; -; https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/s/cell-lines-detail-398.html Provider; MSKCC; -; https://www.mskcc.org/research-advantage/support/technology/tangible-material/human-neuroblastoma-cell-line-sk-n-sh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=4748425 DOI=10.1007/978-1-4757-1647-4_13 PubMed=62055; DOI=10.1093/jnci/57.3.683 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=922665; DOI=10.1002/1097-0142(197711)40:5<2256::AID-CNCR2820400536>3.0.CO;2-1 PubMed=29704 PubMed=6935474; DOI=10.1093/jnci/66.2.239 PubMed=7037175 DOI=10.1016/B978-0-12-008304-6.50015-4 DOI=10.1159/000407025 PubMed=6888561; DOI=10.1038/305245a0 PubMed=6582512; DOI=10.1073/pnas.81.2.568; PMCID=PMC344720 PubMed=6610792; DOI=10.1093/jnci/73.1.51 PubMed=2987426; DOI=10.1007/BF00165170 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=2846152 PubMed=2535691 PubMed=1354203; DOI=10.1002/ijc.2910520116 PubMed=8490657; DOI=10.1038/ng0193-62 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50006-X PubMed=8040301; DOI=10.1172/JCI117360; PMCID=PMC295111 PubMed=8069455; DOI=10.1007/BF02631450 PubMed=7838528 PubMed=8617485; DOI=10.1016/S0046-8177(96)90115-X PubMed=8665486; DOI=10.1016/0304-3835(96)04250-4 DOI=10.1007/0-306-46872-7_2 PubMed=10074188; DOI=10.1128/JVI.73.4.3338-3350.1999; PMCID=PMC104098 PubMed=10630978; DOI=10.1667/0033-7587(2000)153[0062:FORIMI]2.0.CO;2 PubMed=11550280; DOI=10.1002/gcc.1174 PubMed=12702577 PubMed=15390183; DOI=10.1002/gcc.20096 PubMed=15892104; DOI=10.1002/gcc.20198 PubMed=16822308; DOI=10.1186/1471-2407-6-177; PMCID=PMC1533846 PubMed=18724359; DOI=10.1038/nature07261; PMCID=PMC2672043 PubMed=18923523; DOI=10.1038/nature07398 PubMed=18923524; DOI=10.1038/nature07399 PubMed=18957096; DOI=10.1186/1756-0500-1-95; PMCID=PMC2615028 PubMed=22213050; DOI=10.1002/ijc.27415; PMCID=PMC3757132 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23325432; DOI=10.1101/gr.147942.112; PMCID=PMC3589544 PubMed=24466371; DOI=10.1593/tlo.13544; PMCID=PMC3890703 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28350380; DOI=10.1038/sdata.2017.33; PMCID=PMC5369315 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | AddexBio; C0005006/4924
ATCC; HTB-11 CancerTools; 161937 CCTCC; GDC0047 CLS; 305028 ECACC; 86012802 ICLC; HTL96019 IZSLER; BS TCL 143 KCB; KCB 200426YJ KCLB; 30011 RCB; RCB0426 Ubigene; YC-C027 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009059
CLO; CLO_0050268 MCCL; MCC:0000430 CLDB; cl4345 CLDB; cl4347 CLDB; cl4348 CLDB; cl4349 CLDB; cl4351 CLDB; cl4352 cancercelllines; CVCL_0531 CCRID; 1101HUM-PUMC000086 CCRID; 3101HUMSCSP5029 CCRID; 3101HUMTCHu51 CCRID; 4201HUM-CCTCC00047 Cell_Model_Passport; SIDM01098 CGH-DB; 62-1 CGH-DB; 9093-4 Cosmic-CLP; 717431 DepMap; ACH-000149 LINCS_LDP; LCL-1971 Lonza; 80 TOKU-E; 3149 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0001620 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821600
BioSample; SAMN03472879 BioSample; SAMN10987849 ENCODE; ENCBS007RAH ENCODE; ENCBS018DDZ ENCODE; ENCBS061YYT ENCODE; ENCBS324TZB ENCODE; ENCBS360ENC ENCODE; ENCBS361ENC ENCODE; ENCBS362ENC ENCODE; ENCBS363ENC ENCODE; ENCBS364ENC ENCODE; ENCBS365ENC ENCODE; ENCBS376ENC ENCODE; ENCBS387WHS ENCODE; ENCBS428ENC ENCODE; ENCBS433ENC ENCODE; ENCBS434ENC ENCODE; ENCBS435ENC ENCODE; ENCBS436ENC ENCODE; ENCBS437ENC ENCODE; ENCBS438ENC ENCODE; ENCBS439KOM ENCODE; ENCBS489AAA ENCODE; ENCBS490AAA ENCODE; ENCBS491AAA ENCODE; ENCBS492AAA ENCODE; ENCBS495AAA ENCODE; ENCBS500EWH ENCODE; ENCBS526AQV ENCODE; ENCBS592MTQ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 1014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307745
ChEMBL-Targets; CHEMBL614924 GDSC; 717431 PharmacoDB; SKNSH_1409_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q28308636 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0003072 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM231674 GEO; GSM231675 GEO; GSM231676 GEO; GSM231677 GEO; GSM231678 GEO; GSM231679 GEO; GSM231680 GEO; GSM231681 GEO; GSM231682 GEO; GSM231683 GEO; GSM231684 GEO; GSM231685 GEO; GSM231686 GEO; GSM231687 GEO; GSM231688 GEO; GSM231689 GEO; GSM231690 GEO; GSM231691 GEO; GSM231692 GEO; GSM231693 GEO; GSM314027 GEO; GSM333814 GEO; GSM563357 GEO; GSM692864 GEO; GSM803335 GEO; GSM887597 GEO; GSM888680 GEO; GSM923419 GEO; GSM923441 GEO; GSM1003626 GEO; GSM1003627 GEO; GSM1003628 GEO; GSM1003629 GEO; GSM1003630 GEO; GSM1003631 GEO; GSM1003632 GEO; GSM1003633 GEO; GSM1008585 GEO; GSM1010735 GEO; GSM1010738 GEO; GSM1010739 GEO; GSM1010750 GEO; GSM1010751 GEO; GSM1010763 GEO; GSM1010767 GEO; GSM1010773 GEO; GSM1010799 GEO; GSM1010806 GEO; GSM1010816 GEO; GSM1010817 GEO; GSM1010834 GEO; GSM1010835 GEO; GSM1010840 GEO; GSM1010858 GEO; GSM1010880 GEO; GSM1010887 GEO; GSM1010897 GEO; GSM1010900 GEO; GSM1010901 GEO; GSM1622296 GEO; GSM1670454 GEO; GSM2371259 GEO; GSM2394365 GEO; GSM2824362 GEO; GSM2824363 GEO; GSM4104597 GEO; GSM4104598 GEO; GSM4104637 GEO; GSM4104638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 697284
Cosmic; 717431 Cosmic; 801743 Cosmic; 848936 Cosmic; 922656 Cosmic; 923830 Cosmic; 930078 Cosmic; 947706 Cosmic; 1019929 Cosmic; 1037355 Cosmic; 1078393 Cosmic; 1082519 Cosmic; 1099151 Cosmic; 1109108 Cosmic; 1109371 Cosmic; 1153800 Cosmic; 1153806 Cosmic; 1162006 Cosmic; 1167420 Cosmic; 1167993 Cosmic; 1518079 Cosmic; 1526640 Cosmic; 2058116 Cosmic; 2131595 Cosmic; 2239469 Cosmic; 2393645 Cosmic; 2485952 IARC_TP53; 23584 Progenetix; CVCL_0531 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 50 |