Cellosaurus SNU-449 (CVCL_0454)
Cell line name | SNU-449 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SNU449; NCI-SNU-449 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SNU-449 (RRID:CVCL_0454) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: Liver Cancer Model Repository (LIMORE). Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Part of: Seoul National University (SNU) cell line collection. Population: Korean. Doubling time: 36 hours (PubMed=7543080); 27.74 hours (PubMed=31378681). Karyotypic information: Has lost chromosome Y. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Transformant: NCBI_TaxID; 10407; Hepatitis B virus (HBV). Omics: Genomics; DNA methylation analysis. Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Genomics; Whole genome sequencing. Omics: Phenotyping; Drug screening. Omics: Proteomics; Expression; Reverse-phase protein array. Omics: Proteomics; Quantitative. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; miRNA profiling; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; Array-based CGH. Omics: Variations; SNP array analysis. Derived from site: In situ; Liver; UBERON=UBERON_0002107. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Adult hepatocellular carcinoma (NCIt: C7956) Adult hepatocellular carcinoma (ORDO: Orphanet_210159) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 52Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2234; Cosmic-CLP=909738; KCLB=00449; PubMed=25877200; PubMed=31378681; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | Info; LCCL; -; https://lccl.zucmanlab.com/hcc/cellLines/SNU449 Info; MCLP; -; https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=7543080; DOI=10.1002/ijc.2910620308 PubMed=8824565; DOI=10.1002/(SICI)1097-0215(19960917)67:6<898::AID-IJC22>3.0.CO;2-X PubMed=19956504; DOI=10.4143/crt.2005.37.1.1; PMCID=PMC2785416 PubMed=16616112; DOI=10.1016/j.cancergencyto.2005.08.022 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23505090; DOI=10.1002/hep.26402 PubMed=23887712; DOI=10.1038/ncomms3218; PMCID=PMC3731665 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25574106; DOI=10.3748/wjg.v21.i1.311; PMCID=PMC4284350 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31063779; DOI=10.1053/j.gastro.2019.05.001 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31378681; DOI=10.1016/j.ccell.2019.07.001; PMCID=PMC7505724 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2234
CLS; 305429 KCLB; 00449 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009100
cancercelllines; CVCL_0454 Cell_Model_Passport; SIDM01194 Cosmic-CLP; 909738 DepMap; ACH-000420 IGRhCellID; SNU449 LIMORE; SNU449 LINCS_LDP; LCL-1936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0003188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471847
BioSample; SAMN03473133 BioSample; SAMN10987611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 367 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308480
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075585 GDSC; 909738 PharmacoDB; SNU449_1462_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54955201 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002349 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM481452 GEO; GSM565924 GEO; GSM887627 GEO; GSM888712 GEO; GSM936782 GEO; GSM1374891 GEO; GSM1670471 GEO; GSM2551589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 684200
Cosmic; 871511 Cosmic; 873396 Cosmic; 909738 Cosmic; 928144 Cosmic; 1187338 Cosmic; 1995642 Cosmic; 2009539 Cosmic; 2023870 Cosmic; 2162541 Cosmic; 2321041 IARC_TP53; 6309 IARC_TP53; 21142 LiGeA; CCLE_155 Progenetix; CVCL_0454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 45 |