Cellosaurus HDLM-2 (CVCL_0009)
Cell line name | HDLM-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HD-LM-2; HDLM2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HDLM-2 (RRID:CVCL_0009) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: Human Protein Atlas, Cell Atlas panel. Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Population: Caucasian. Doubling time: ~70-75 hours (DSMZ=ACC-17). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Genomics; DNA methylation analysis. Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Phenotyping; Drug screening. Omics: Proteomics; Expression; Large antibody panel staining analysis. Omics: Proteomics; Quantitative. Omics: Proteomics; Subcellular; Cell surface. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; SNP array analysis. Derived from site: In situ; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: DSMZCellDive=ACC-17
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Hodgkin lymphoma (NCIt: C9357) Hodgkin lymphoma (ORDO: Orphanet_98293) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Originate from same individual | CVCL_M693 ! HDLM-1 CVCL_M697 ! HDLM-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 74Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=924110; DSMZ=ACC-17 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | Info; HPA; -; https://www.proteinatlas.org/learn/cellines | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=3713248; DOI=10.1016/0145-2126(86)90084-6 PubMed=2602652; DOI=10.1007/978-3-642-83781-4_8 PubMed=2690233; DOI=10.1007/978-3-642-83781-4_5 PubMed=8558920 PubMed=9685479; DOI=10.1093/nar/26.16.3651; PMCID=PMC147775 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=12581897; DOI=10.1016/S0165-4608(02)00656-8 PubMed=17065008; DOI=10.1080/10428190600667721 PubMed=19380639; DOI=10.1084/jem.20090528; PMCID=PMC2715030 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20628145; DOI=10.1182/blood-2010-05-282780; PMCID=PMC2995356 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25894527; DOI=10.1371/journal.pone.0121314; PMCID=PMC4404347 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=29533902; DOI=10.1515/hsz-2017-0321 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x; PMCID=PMC6547646 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003671
CLDB; cl1580 cancercelllines; CVCL_0009 Cell_Model_Passport; SIDM01064 Cosmic-CLP; 924110 DepMap; ACH-000267 DSMZCellDive; ACC-17 IGRhCellID; HDLM2 LINCS_LDP; LCL-2007 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473364
BioSample; SAMN10988513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308234
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366231 GDSC; 924110 PharmacoDB; HDLM2_521_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54882175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM335390 GEO; GSM381298 GEO; GSM499724 GEO; GSM499732 GEO; GSM552430 GEO; GSM646534 GEO; GSM887064 GEO; GSM888134 GEO; GSM1669870 GEO; GSM7701399 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 924110
Cosmic; 988701 Cosmic; 1013909 Cosmic; 1086355 Cosmic; 1278832 Cosmic; 1289699 Cosmic; 1290220 Cosmic; 1432040 Cosmic; 2276322 Cosmic; 2464309 IARC_TP53; 23613 Progenetix; CVCL_0009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD000589
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 43 |