Cellosaurus (CVCL_C994)
| Comments | Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Population: Japanese. Doubling time: 36 hours (Note=At 9th passage), 29 hours (Note=At 40th passage), 27 hours (Note=At 50th passage) (DOI=10.1007/978-4-431-53981-0_2); 35.14 +- 2.68 hours (PubMed=23255909). Omics: Genomics; ChIP-seq; H3K27ac. Omics: Genomics; Chromatin accessibility; ATAC-seq. Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Phenotyping; CRISPR screening. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; Array-based CGH. Omics: Variations; SNP array analysis. Miscellaneous: DepMap data are indicated for Ishidisconkawa (Heraklio) 02 ER- (CVCL_6543), but the referenced ECACC provider corresponds to Ishikawa (CVCL_2529). Misspelling: Ischikawaa; Note=Occasionally. Derived from site: In situ; Endometrium; UBERON=UBERON_0001295. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Sequence variations |
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| Disease | Type I endometrial adenocarcinoma (NCIt: C40145) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Age at sampling | 39Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STR profile | Source(s): ECACC=99040201; PubMed=25877200; DepMap=ACH-000961 Markers:
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| Web pages | Info; ENCODE; -; http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/Ishikawa_Crawford_protocol.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Publications |
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| Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell line collections (Providers) | ECACC; 99040201
EDITGENE; EDC00203 Ubigene; YC-D023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cell line databases/resources | DepMap; ACH-000961
LINCS_HMS; 50018 LINCS_LDP; LCL-1497 TOKU-E; 3966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological sample resources | ENCODE; ENCBS228AAA
ENCODE; ENCBS229AAA ENCODE; ENCBS230AAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemistry resources | PharmacoDB; Ishikawa_667_2019
PubChem_Cell_line; CVCL_2529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Encyclopedic resources | Wikidata; Q54898281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene expression databases | GEO; GSM374972
GEO; GSM375431 GEO; GSM827370 GEO; GSM1008593 GEO; GSM1008594 GEO; GSM1669941 GEO; GSM3161714 GEO; GSM3161715 GEO; GSM6421758 GEO; GSM6421759 GEO; GSM6421760 GEO; GSM6421769 GEO; GSM6421770 GEO; GSM6421771 GEO; GSM6421772 GEO; GSM6421773 GEO; GSM6421774 GEO; GSM6421775 GEO; GSM6421776 GEO; GSM6727286 GEO; GSM6727287 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1696753
Cosmic; 2030475 Cosmic; 2464666 Cosmic; 2646616 Cosmic; 2702440 IARC_TP53; 1112 Progenetix; CVCL_2529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Last entry update | 25-Jun-2026 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Version number | 40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||