Cellosaurus C80 (CVCL_5249)
Cell line name | C80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Accession | CVCL_5249 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: C80 (RRID:CVCL_5249) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: AstraZeneca Colorectal cell line (AZCL) panel. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=24755471; PubMed=25926053). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Rectum; UBERON=UBERON_0001052. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=8464898
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Disease | Rectal adenocarcinoma (NCIt: C9383) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 69Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DepMap=ACH-001459; ECACC=12022904; PubMed=25926053 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8464898; DOI=10.1073/pnas.90.7.2842; PMCID=PMC46192 PubMed=10051639; DOI=10.1073/pnas.96.5.2316; PMCID=PMC26781 PubMed=10737795; DOI=10.1073/pnas.97.7.3352; PMCID=PMC16243 PubMed=16418264; DOI=10.1073/pnas.0510146103; PMCID=PMC1327731 PubMed=18258742; DOI=10.1073/pnas.0712176105; PMCID=PMC2268141 PubMed=20570890; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-10-0192; PMCID=PMC2943514 PubMed=20606684; DOI=10.1038/sj.bjc.6605780; PMCID=PMC2920028 PubMed=23272949; DOI=10.1186/1755-8794-5-66; PMCID=PMC3543849 PubMed=24755471; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-14-0013 PubMed=25926053; DOI=10.1038/ncomms8002 PubMed=29101300; DOI=10.15252/msb.20177701; PMCID=PMC5731344 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | CancerTools; 151759
ECACC; 12022904 - Discontinued Ximbio; 151759 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_5249
Cell_Model_Passport; SIDM01549 ColonAtlas; C80 DepMap; ACH-001459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54808248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM1346863
GEO; GSM1374423 GEO; GSM1448202 GEO; GSM3145696 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 948830
Cosmic; 986010 Cosmic; 995390 Cosmic; 1043802 Cosmic; 1223132 Cosmic; 1312294 Cosmic; 1479604 Cosmic; 2301961 Cosmic; 2760096 IARC_TP53; 21747 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD005354
PRIDE; PXD005355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 31 |