Cellosaurus HCC2279 (CVCL_5131)
Cell line name | HCC2279 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HCC-2279; Hamon Cancer Center 2279 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_5131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCC2279 (RRID:CVCL_5131) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Asian. Doubling time: 49.3 hours (PubMed=29681454). Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Proteomics; Expression; Reverse-phase protein array. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; Array-based CGH. Omics: Variations; SNP array analysis. Misspelling: HCC227; EFO=EFO_0005374. Derived from site: In situ; Lung; UBERON=UBERON_0002048. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung adenosquamous carcinoma (NCIt: C9133) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 52Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2870; KCLB=72279; PubMed=20679594; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | Info; MCLP; -; https://tcpaportal.org/mclp/ Provider; UT Southwestern; -; https://www.utsouthwestern.edu/edumedia/edufiles/about_us/admin_offices/technology_development/available_technologies/cell-lines.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10353731 PubMed=16187286; DOI=10.1002/ijc.21491 PubMed=20679594; DOI=10.1093/jnci/djq279; PMCID=PMC2935474 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=22961666; DOI=10.1158/2159-8290.CD-12-0112; PMCID=PMC3567922 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=29681454; DOI=10.1016/j.cell.2018.03.028; PMCID=PMC5935540 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564; PMCID=PMC7496084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2870 - Discontinued
KCLB; 72279 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_5131
Cell_Model_Passport; SIDM01602 DepMap; ACH-000731 IGRhCellID; HCC2279GEO | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0006025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472992
BioSample; SAMN10987735 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; HCC2279_455_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54881640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM63348 GEO; GSM108867 GEO; GSM108868 GEO; GSM253421 GEO; GSM434283 GEO; GSM794392 GEO; GSM887050 GEO; GSM888120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 903642
Cosmic; 1128248 Cosmic; 1146930 IARC_TP53; 11454 LiGeA; CCLE_256 Progenetix; CVCL_5131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 36 |