Cellosaurus SW872 (CVCL_1730)
Cell line name | SW872 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SW-872; SW 872 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1730 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SW872 (RRID:CVCL_1730) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. From: Scott and White Clinic; Temple; USA. Population: Caucasian. Doubling time: 24 hours (PubMed=16888811). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Misspelling: SW672; PubMed=17431109. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: CLS=300405
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Liposarcoma (NCIt: C3194) Liposarcoma (ORDO: Orphanet_69078) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 36Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-92; CLS=300405; Cosmic-CLP=909756 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=6220172 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=12068308; DOI=10.1038/nature00766 PubMed=16888811; DOI=10.1002/jcb.21073 PubMed=17354236; DOI=10.1002/ijc.22643 PubMed=17426441; DOI=10.4161/cbt.6.4.3816 PubMed=17431109; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-06-0729 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22911243; DOI=10.1155/2012/148614; PMCID=PMC3403520 PubMed=24726063; DOI=10.1186/1756-9966-33-33; PMCID=PMC4022359 PubMed=24758355; DOI=10.1186/1471-2407-14-281; PMCID=PMC4023704 PubMed=26643872; DOI=10.18632/oncotarget.6464; PMCID=PMC4767443 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-92
BCRC; 60432 CLS; 300405 IZSLER; BS TCL 119 NCBI_Iran; C638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009201
CLO; CLO_0037071 cancercelllines; CVCL_1730 Cell_Model_Passport; SIDM01159 Cosmic-CLP; 909756 DepMap; ACH-002310 IGRhCellID; SW872 LINCS_LDP; LCL-1459 Lonza; 88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0003743 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308837
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366302 GDSC; 909756 PharmacoDB; SW872_1547_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1730 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54971215 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM185156 GEO; GSM185157 GEO; GSM482514 GEO; GSM1543668 GEO; GSM1543669 GEO; GSM1670514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 684521
Cosmic; 909756 Cosmic; 923383 Cosmic; 2009544 Cosmic; 2307722 Cosmic; 2560246 Cosmic; 2800532 IARC_TP53; 24518 Progenetix; CVCL_1730 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 41 |