Cellosaurus SK-N-DZ (CVCL_1701)
Cell line name | SK-N-DZ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SKNDZ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1701 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SK-N-DZ (RRID:CVCL_1701) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. From: Memorial Sloan Kettering Cancer Center; New York; USA. Population: Caucasian and Native North American. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Bone marrow; UBERON=UBERON_0002371. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Neuroblastoma (NCIt: C3270) Neuroblastoma (ORDO: Orphanet_635) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 2Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio=C0005020/5011; ATCC=CRL-2149; Cosmic-CLP=688086; ECACC=94092305; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | DOI=10.1159/000407025 PubMed=6610792; DOI=10.1093/jnci/73.1.51 PubMed=2987426; DOI=10.1007/BF00165170 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50006-X PubMed=12702577 PubMed=16822308; DOI=10.1186/1471-2407-6-177; PMCID=PMC1533846 PubMed=18082704; DOI=10.1016/j.jpedsurg.2007.08.026 PubMed=18724359; DOI=10.1038/nature07261; PMCID=PMC2672043 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28350380; DOI=10.1038/sdata.2017.33; PMCID=PMC5369315 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | AddexBio; C0005020/5011
ATCC; CRL-2149 ECACC; 94092305 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009054
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Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0004217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | 4DN; 4DNSRPJISWJY
BioSample; SAMN03473093 BioSample; SAMN10988189 ENCODE; ENCBS373BOT ENCODE; ENCBS439FDS ENCODE; ENCBS478IFE ENCODE; ENCBS514GVM ENCODE; ENCBS520AAA ENCODE; ENCBS521AAA ENCODE; ENCBS580YYW ENCODE; ENCBS707BMT ENCODE; ENCBS715HTH ENCODE; ENCBS773LCT ENCODE; ENCBS893THB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308474
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075579 GDSC; 688086 PharmacoDB; SKNDZ_1406_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1701 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54954471 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0005721 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887594 GEO; GSM888677 GEO; GSM1366412 GEO; GSM1670451 GEO; GSM2371257 GEO; GSM2394372 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Cosmic; 897447 Cosmic; 930076 Cosmic; 1019931 Cosmic; 1109370 Cosmic; 1162004 Cosmic; 1167415 Cosmic; 2058115 Cosmic; 2485951 IARC_TP53; 27242 LiGeA; CCLE_236 Progenetix; CVCL_1701 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD010745
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |