Cellosaurus RPMI-7951 (CVCL_1666)
Cell line name | RPMI-7951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | RPMI 7951; RPMI7951; Roswell Park Memorial Institute 7951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1666 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: RPMI-7951 (RRID:CVCL_1666) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: BRAF genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1032). Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Part of: PTEN genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1030). Part of: TCGA-110-CL cell line panel. Population: Caucasian. Doubling time: 50 hours (PubMed=1161259); ~60 hours (DSMZ=ACC-66). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Genomics; DNA methylation analysis. Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Phenotyping; Drug screening. Omics: Proteomics. Omics: Proteomics; PTM; Phosphorylation. Omics: Proteomics; Quantitative. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; SNP array analysis. Derived from site: Metastatic; Lymph node; UBERON=UBERON_0000029. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Melanoma (NCIt: C3224) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 18Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-66; Cosmic-CLP=910903; DSMZ=ACC-66; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | Info; ENCODE; -; http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/RPMI7951_Stam_protocol.pdf Info; NCI DTP; NCI-60 additional lines; https://dtp.cancer.gov/discovery_development/nci-60/cell_list.htm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1161259; DOI=10.1159/000225003 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 DOI=10.1007/BF00199208 PubMed=3335022 PubMed=11668190; DOI=10.1177/002215540104901105 PubMed=12068308; DOI=10.1038/nature00766 PubMed=15467732; DOI=10.1038/sj.onc.1208152 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23285177; DOI=10.1371/journal.pone.0052760; PMCID=PMC3532357 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31395879; DOI=10.1038/s41467-019-11415-2; PMCID=PMC6687785 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-66
BCRC; 60274 DSMZ; ACC-66 KCLB; 30066 - Discontinued NCI-DTP; RPMI-7951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008877
CLDB; cl4187 cancercelllines; CVCL_1666 Cell_Model_Passport; SIDM01087 CGH-DB; 9320-4 Cosmic-CLP; 910903 DepMap; ACH-000348 DSMZCellDive; ACC-66 LINCS_LDP; LCL-1254 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0003508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | 4DN; 4DNSRQW8GWCI
BioSample; SAMN03471611 BioSample; SAMN03473473 BioSample; SAMN10987964 ENCODE; ENCBS262AAA ENCODE; ENCBS457YHI ENCODE; ENCBS493TPA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307962
ChEMBL-Targets; CHEMBL612447 GDSC; 910903 PharmacoDB; RPMI7951_1326_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1666 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54951235 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0005712 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM206540 GEO; GSM274689 GEO; GSM827474 GEO; GSM887547 GEO; GSM888630 GEO; GSM1670388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687439
Cosmic; 905233 Cosmic; 910903 Cosmic; 933001 Cosmic; 1022287 Cosmic; 1303050 Cosmic; 1507596 Cosmic; 2233666 IARC_TP53; 13321 IARC_TP53; 27231 LiGeA; CCLE_303 Progenetix; CVCL_1666 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD022992
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 46 |