Cellosaurus MFM-223 (CVCL_1408)
Cell line name | MFM-223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | MFM223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1408 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: MFM-223 (RRID:CVCL_1408) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: GrayJW breast cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: 184 hours (at 12th passage), ~70 hours (at 35th passage) (PubMed=1913690); ~5-7 days (DSMZ=ACC-422). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Breast carcinoma (NCIt: C4872) Derived from metastatic site: Pleural effusion. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | >45Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; DepMap; DSMZ; ECACC; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2346643/wiki/62255 https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1913690 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50009-5 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=22414580; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-11-3711 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25892236; DOI=10.1016/j.celrep.2015.03.050 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | DSMZ; ACC-422
ECACC; 98050130 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007695
Cell_Model_Passport; SIDM00332 Cosmic-CLP; 910948 DepMap; ACH-001819 DSMZCellDive; ACC-422 LINCS_LDP; LCL-1318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473045
BioSample; SAMN03473592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308115
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075504 GDSC; 910948 PharmacoDB; MFM223_923_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1408 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54905396 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM344380 GEO; GSM344430 GEO; GSM595616 GEO; GSM783967 GEO; GSM1172985 GEO; GSM1670102 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 910948
Cosmic; 2165000 IARC_TP53; 21497 Progenetix; CVCL_1408 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD000309
PRIDE; PXD008222 PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 21-Mar-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 37 |