Cellosaurus LXF 289 (CVCL_1394)
Cell line name | LXF 289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | LXF289; LXF-289; LXF 289L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: LXF 289 (RRID:CVCL_1394) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Virology: Infected with a murine leukemia virus-related virus (PubMed=30629668). Doubling time: ~50 hours (DSMZ=ACC-265); 24-48 hours (CLS). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Misspelling: LX-289; Note=Occasionally. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung adenocarcinoma (NCIt: C3512) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 62Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): CLS; Cosmic-CLP; DSMZ; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | CLS; 300269
DSMZ; ACC-265 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007424
CLDB; cl3278 Cell_Model_Passport; SIDM00339 Cosmic-CLP; 753592 DepMap; ACH-000787 DSMZCellDive; ACC-265 LINCS_LDP; LCL-1668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473043
BioSample; SAMN10988494 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307871
ChEMBL-Targets; CHEMBL614107 GDSC; 753592 PharmacoDB; LXF289_872_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54903304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006641 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM513972 GEO; GSM514324 GEO; GSM784227 GEO; GSM887285 GEO; GSM888360 GEO; GSM1670069 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 753592
Cosmic; 1995499 IARC_TP53; 21484 LiGeA; CCLE_089 Progenetix; CVCL_1394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 21-Mar-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 36 |