Cellosaurus KYSE-30 (CVCL_1351)
Cell line name | KYSE-30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Kyse-30; KYSE 30; KYSE30; Kyse30; KYSE0030 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: KYSE-30 (RRID:CVCL_1351) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: KuDOS 95 cell line panel. Population: Japanese. Doubling time: 20.8 hours (PubMed=1728357); 22 hours (PubMed=25984343); ~30 hours (DSMZ=ACC-351). Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Phenotyping; Drug screening. Omics: Phenotyping; shRNA library screening. Omics: Proteomics; Quantitative. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; SNP array analysis. Misspelling: KYSE-300; Cosmic=801333. Derived from site: In situ; Esophagus; UBERON=UBERON_0001043. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Esophageal squamous cell carcinoma (NCIt: C4024) Squamous cell carcinoma of the esophagus (ORDO: Orphanet_99977) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 64Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DSMZ=ACC-351; JCRB=JCRB0188; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1728357; DOI=10.1002/1097-0142(19920115)69:2<277::AID-CNCR2820690202>3.0.CO;2-C PubMed=7913084; DOI=10.1002/ijc.2910580224 PubMed=8575860; DOI=10.1002/(SICI)1097-0215(19960126)65:3<372::AID-IJC16>3.0.CO;2-C PubMed=9033652; DOI=10.1002/(SICI)1097-0215(19970207)70:4<437::AID-IJC11>3.0.CO;2-C PubMed=11092977; DOI=10.1111/j.1349-7006.2000.tb00895.x; PMCID=PMC5926289 PubMed=11520067; DOI=10.1006/bbrc.2001.5400 PubMed=12963126; DOI=10.1016/S0304-3835(03)00344-6 PubMed=15172977; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-04-0172 PubMed=16045545; DOI=10.1111/j.0959-9673.2005.00431.x; PMCID=PMC2517430 PubMed=16364037; DOI=10.1111/j.1442-2050.2006.00530.x PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=21191746; DOI=10.1007/s11684-010-0260-x PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35; PMCID=PMC4432652 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | BCRJ; 0404
CLS; 305094 DSMZ; ACC-351 ECACC; 94072011 ICLC; HTL97022 JCRB; JCRB0188 NCBI_Iran; C584 Ubigene; YC-C054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007132
CLDB; cl3073 CLDB; cl3074 cancercelllines; CVCL_1351 Cell_Model_Passport; SIDM00015 CGH-DB; 274-1 CGH-DB; 9223-4 DepMap; ACH-000777 DSMZCellDive; ACC-351 IGRhCellID; KYSE30 LINCS_LDP; LCL-1553 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0004461 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471050
BioSample; SAMN03471648 BioSample; SAMN03473314 BioSample; SAMN10988382 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 411 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4513120
ChEMBL-Targets; CHEMBL4513130 GDSC; 1298221 PharmacoDB; KYSE30_806_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54900823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM827542 GEO; GSM887251 GEO; GSM888326 GEO; GSM1374609 GEO; GSM1374610 GEO; GSM1374611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 801333
Cosmic; 918521 Cosmic; 1123333 Cosmic; 1298221 Cosmic; 1339921 Cosmic; 1581068 Cosmic; 1876249 Cosmic; 2267697 Cosmic; 2395004 Cosmic; 2650627 Cosmic; 2698430 IARC_TP53; 7691 LiGeA; CCLE_634 Progenetix; CVCL_1351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 46 |