Cellosaurus COLO 824 (CVCL_1136)
Cell line name | COLO 824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | COLO-824; Colo-824; Colo 824; COLO #824; COLO824; Colo824; Colorado 824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: COLO 824 (RRID:CVCL_1136) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: JWGray breast cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: African American. Doubling time: ~60-80 hours (DSMZ=ACC-200). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Caution: Previously erroneously indicated as originating from a male patient, correct sex assignment from Moore G.E. in a personal communication to the authors of PubMed=9892114. Derived from site: Metastatic; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Breast carcinoma (NCIt: C4872) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 52Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): CLS=300463; Cosmic-CLP=906812; DepMap=ACH-001820; DSMZ=ACC-200; PubMed=25877200 Markers:
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Web pages | https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2346643/wiki/62255 https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9892114; DOI=10.1002/(SICI)1098-2264(199901)24:1<87::AID-GCC13>3.0.CO;2-5 PubMed=10969801 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110; PMCID=PMC3937590 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | CLS; 300463
DSMZ; ACC-200 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002577
CLDB; cl870 cancercelllines; CVCL_1136 Cell_Model_Passport; SIDM00954 Cosmic-CLP; 906812 DepMap; ACH-001820 DSMZCellDive; ACC-200 LINCS_LDP; LCL-1477 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471347
BioSample; SAMN03473374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 850 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308725
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075430 GDSC; 906812 PharmacoDB; COLO824_237_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54814156 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM718287 GEO; GSM783979 GEO; GSM847249 GEO; GSM847459 GEO; GSM843492 GEO; GSM843493 GEO; GSM1669694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 906812
IARC_TP53; 21245 Progenetix; CVCL_1136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |