Cellosaurus BC-3 (CVCL_1080)
Cell line name | BC-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | BC3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: BC-3 (RRID:CVCL_1080) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Group: Patented cell line. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Registration: International Depositary Authority, American Type Culture Collection (ATCC); CRL-2277. Population: Caucasian. Doubling time: ~50-60 hours (DSMZ=ACC-679). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Transformant: NCBI_TaxID; 37296; Human herpesvirus 8 (HHV-8/KSHV). Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: DSMZCellDive=ACC-679
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Primary effusion lymphoma (NCIt: C6915) Primary effusion lymphoma (ORDO: Orphanet_48686) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_4J72 ! KS-1 [Human primary effusion lymphoma] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 85Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-3615; Cosmic-CLP=910918; DSMZ=ACC-679 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://cornell.flintbox.com/technologies/d21d6b39-b480-4ad4-8785-cc7a70c91788 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8839859; DOI=10.1182/blood.V88.7.2648.bloodjournal8872648 PubMed=9766492; DOI=10.1038/sj.leu.2401160 Patent=US5908773 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=15613351; DOI=10.1128/JVI.79.2.1244-1251.2005; PMCID=PMC538532 PubMed=17121789; DOI=10.1128/JVI.01757-06; PMCID=PMC1797584 PubMed=19608668; DOI=10.3324/haematol.2009.007260; PMCID=PMC2719041 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=21685375; DOI=10.1182/blood-2010-12-323659; PMCID=PMC3158728 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x; PMCID=PMC6547646 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2277 - Discontinued
ATCC; CRL-3615 CCTCC; GDC0221 DSMZ; ACC-679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0001891
cancercelllines; CVCL_1080 CCRID; 3101HUMSCSP5016 Cell_Model_Passport; SIDM00895 Cosmic-CLP; 910918 DepMap; ACH-002215 DSMZCellDive; ACC-679 IGRhCellID; BC3 LINCS_LDP; LCL-1948 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0002722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472835
BioSamples; SAMEA365848 BioSamples; SAMEA365859 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 1098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308890
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366371 GDSC; 910918 PharmacoDB; BC3_79_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54795189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002046 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM33135 GEO; GSM38796 GEO; GSM38797 GEO; GSM634733 GEO; GSM710419 GEO; GSM710435 GEO; GSM1669611 GEO; GSM3150237 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687836
Cosmic; 910918 Cosmic; 1238077 Cosmic; 1515188 Cosmic; 1588558 IARC_TP53; 21190 IARC_TP53; 26979 Progenetix; CVCL_1080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD012087
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 40 |