Cellosaurus WM35 (CVCL_0580)
Cell line name | WM35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | WM-35; WM 35; WC00060 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0580 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: WM35 (RRID:CVCL_0580) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: Wistar Institute melanoma cell line collection. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Caution: The reported STR profile from Wistar of this cell line was changed at one point between February 2016 when we retrieved them and entered them in the Cellosaurus and May 2018. The major changes were: D18S51: 20->14,15 and FGA: 19->19,24. Derived from site: In situ; Skin; UBERON=UBERON_0002097. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Cutaneous melanoma (NCIt: C3510) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 24Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; Cosmic-CLP; PubMed=27087056; Wistar Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://web.archive.org/web/20141129125241/http://www.wistar.org:80/lab/meenhard-herlyn-dvm-dsc/page/melanoma-cell-lines-0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2253310; DOI=10.1007/BF00046337 PubMed=2068080; DOI=10.1073/pnas.88.14.6028 PubMed=8160777 PubMed=11123321; DOI=10.4049/jimmunol.166.1.432 PubMed=16827748; DOI=10.1111/j.1600-0749.2006.00322.x PubMed=18632627; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-08-0235 PubMed=18790768; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-08-0431 PubMed=23039341; DOI=10.1186/1476-4598-11-75 PubMed=27087056; DOI=10.1038/srep24569 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2807 - Discontinued
Coriell; WC00060 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009617
MCCL; MCC:0000486 cancercelllines; CVCL_0580 Cell_Model_Passport; SIDM00974 Cosmic-CLP; 1299080 DepMap; ACH-002207 LINCS_LDP; LCL-1263 Lonza; 583 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0003475 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1299080
PharmacoDB; WM35_1672_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54994256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-3610
GEO; GSM109040 GEO; GSM186484 GEO; GSM186485 GEO; GSM188068 GEO; GSM188120 GEO; GSM188193 GEO; GSM188208 GEO; GSM188213 GEO; GSM188284 GEO; GSM188293 GEO; GSM555119 GEO; GSM555188 GEO; GSM952586 GEO; GSM1670580 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 686396
Cosmic; 886834 Cosmic; 1155548 Cosmic; 1187584 Cosmic; 1247866 Cosmic; 1303075 Cosmic; 1507600 Cosmic; 1995666 Cosmic; 2159431 Progenetix; CVCL_0580 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 05-Oct-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 32 |