Cellosaurus KNS-42 (CVCL_0378)
Cell line name | KNS-42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | KNS42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: KNS-42 (RRID:CVCL_0378) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Japanese. Doubling time: 48 hours (CelloPub=CLPUB00152; PubMed=19365568). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Genomics; ChIP-seq; H3K27ac. Omics: Genomics; ChIP-seq; H3K27me3. Omics: Genomics; DNA methylation analysis. Omics: Genomics; Whole exome sequencing. Omics: Phenotyping; CRISPR screening. Omics: Phenotyping; Drug screening. Omics: Proteomics; Quantitative. Omics: Transcriptomics; Microarray. Omics: Transcriptomics; RNAseq. Omics: Variations; CNV analysis. Omics: Variations; SNP array analysis. Derived from site: In situ; Brain, right fronto-parietal lobe. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Glioblastoma, IDH-wildtype (NCIt: C39750) Glioblastoma (ORDO: Orphanet_360) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 16Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=907282; JCRB=IFO50356; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2448680; DOI=10.2176/nmc.27.581 CLPUB00152 PubMed=16232199; DOI=10.1111/j.1349-7006.2005.00099.x; PMCID=PMC11159392 PubMed=19365568; DOI=10.1371/journal.pone.0005209; PMCID=PMC2666263 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25401693; DOI=10.1038/nm.3716; PMCID=PMC4257862 PubMed=25628092; DOI=10.1038/bjc.2015.16; PMCID=PMC4333505 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=34078608; DOI=10.1126/sciadv.abg4126; PMCID=PMC10166578 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | BCRJ; 0295
JCRB; IFO50356 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009894
MCCL; MCC:0000273 cancercelllines; CVCL_0378 Cell_Model_Passport; SIDM00607 CGH-DB; 144-1 Cosmic-CLP; 907282 DepMap; ACH-000622 LINCS_LDP; LCL-1382 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0005859 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472787
BioSample; SAMN10987931 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 617 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308538
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366261 GDSC; 907282 PharmacoDB; KNS42_773_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54900250 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887229 GEO; GSM888303 GEO; GSM1669995 GEO; GSM2197880 GEO; GSM2197881 GEO; GSM2197882 GEO; GSM2197883 GEO; GSM2197884 GEO; GSM2197885 GEO; GSM4969600 GEO; GSM4969601 GEO; GSM4969617 GEO; GSM4969634 GEO; GSM4969635 GEO; GSM4969636 GEO; GSM5356021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687573
Cosmic; 907282 Cosmic; 2367532 IARC_TP53; 21436 LiGeA; CCLE_847 Progenetix; CVCL_0378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Apr-2025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 41 |