Cellosaurus T3M-4 (CVCL_4056)
Cell line name | T3M-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | T3M4; Panc89; Panc-89; PANC-89; Panc 89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_4056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: T3M-4 (RRID:CVCL_4056) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: KuDOS 95 cell line panel. Population: Japanese. Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Lymph node; UBERON=UBERON_0000029. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Pancreatic ductal adenocarcinoma (NCIt: C9120) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 64Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): CCRID=1101HUM-PUMC000815; RCB=RCB1021; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.cellosaurus.org/pawefish/PancCellLineDescriptions/T3M-4.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6821838; DOI=10.1002/1097-0142(19830215)51:4<662::AID-CNCR2820510419>3.0.CO;2-X PubMed=8426738 PubMed=11169959; DOI=10.1002/1097-0215(200002)9999:9999<::AID-IJC1049>3.0.CO;2-C PubMed=11787853; DOI=10.1007/s004280100474 PubMed=12692724; DOI=10.1007/s00428-003-0784-4 PubMed=18298655; DOI=10.1111/j.1582-4934.2008.00289.x; PMCID=PMC3828895 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | RCB; RCB1021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0050113
cancercelllines; CVCL_4056 CCRID; 1101HUM-PUMC000815 Cell_Model_Passport; SIDM01469 DepMap; ACH-000085 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0002864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472207
BioSample; SAMN10988105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; T3M4_1557_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54971538 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002714 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
GEO; GSM887684 GEO; GSM888776 GEO; GSM1374814 GEO; GSM1374815 GEO; GSM1374816 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 710873
Cosmic; 724641 Cosmic; 736281 Cosmic; 922257 Cosmic; 922263 Cosmic; 933528 Cosmic; 2546061 Cosmic; 2546062 IARC_TP53; 1561 IARC_TP53; 16746 LiGeA; CCLE_195 Progenetix; CVCL_4056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 32 |