Cellosaurus HCC1588 (CVCL_A351)
Cell line name | HCC1588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | HCC-1588; Hamon Cancer Center 1588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_A351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCC1588 (RRID:CVCL_A351) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Population: African American. Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Lung; UBERON=UBERON_0002048. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Lung squamous cell carcinoma (NCIt: C3493) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 63Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): KCLB=71588; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.utsouthwestern.edu/edumedia/edufiles/about_us/admin_offices/technology_development/available_technologies/cell-lines.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10353731 PubMed=24002593; DOI=10.1038/bjc.2013.452; PMCID=PMC3776976 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=29681454; DOI=10.1016/j.cell.2018.03.028; PMCID=PMC5935540 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564; PMCID=PMC7496084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | KCLB; 71588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_A351
Cell_Model_Passport; SIDM01820 DepMap; ACH-001078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473071
BioSample; SAMN10987742 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; HCC1588_451_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54881590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
GEO; GSM1374503 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 903638
IARC_TP53; 11451 LiGeA; CCLE_148 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 06-Jun-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 25 |