Cellosaurus NB-1643 (CVCL_5627)
Cell line name | NB-1643 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | NB1643; NB 1643 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_5627 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: NB-1643 (RRID:CVCL_5627) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: NCI Pediatric Preclinical Testing Program (PPTP) cell line panel. Doubling time: 43 hours (PubMed=20922763). Omics: Chromatin accessibility by ATAC-seq. Omics: Deep exome analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Retroperitoneal space; UBERON=UBERON_0003693. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Neuroblastoma (NCIt: C3270) Neuroblastoma (ORDO: Orphanet_635) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 3Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DepMap=ACH-001303; PubMed=20922763 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.cccells.org/PDF_Files/NB_Cell_Lines/NB-1643%20Cell%20Line%20Data%20Sheet.pdf http://www.pptpinvitro.org/cell_lines_panel.php | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9815701 PubMed=9802058 PubMed=18724359; DOI=10.1038/nature07261; PMCID=PMC2672043 PubMed=20922763; DOI=10.1002/pbc.22801; PMCID=PMC3005554 PubMed=23202128; DOI=10.1038/ng.2493; PMCID=PMC3557959 PubMed=28350380; DOI=10.1038/sdata.2017.33; PMCID=PMC5369315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_5627
Cell_Model_Passport; SIDM01388 DepMap; ACH-001303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0002833 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54907501 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM2371243
GEO; GSM2394390 GEO; GSM4104583 GEO; GSM4104584 GEO; GSM4104630 GEO; GSM4104631 GEO; GSM4105318 GEO; GSM4105319 GEO; GSM4105320 GEO; GSM4105321 GEO; GSM4105322 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1161994
Cosmic; 1890114 IARC_TP53; 23603 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 23 |