Cellosaurus HCC515 (CVCL_5136)
Cell line name | HCC515 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HCC-515; HCC0515; Hamon Cancer Center 515 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_5136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCC515 (RRID:CVCL_5136) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: 39.3 hours (PubMed=29681454). Omics: Deep exome analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Lymph node; UBERON=UBERON_0000029. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Disease | Lung adenocarcinoma (NCIt: C3512) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_S839 ! HCC515 BL | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 39Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): PubMed=20679594; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.utsouthwestern.edu/edumedia/edufiles/about_us/admin_offices/technology_development/available_technologies/cell-lines.pdf https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9559342; DOI=10.1002/(SICI)1098-2264(199804)21:4<308::AID-GCC4>3.0.CO;2-2 PubMed=10987304 PubMed=11314036; DOI=10.1038/sj.onc.1204211 PubMed=19472407; DOI=10.1002/humu.21028; PMCID=PMC2900846 PubMed=20557307; DOI=10.1111/j.1349-7006.2010.01622.x; PMCID=PMC11158680 PubMed=20679594; DOI=10.1093/jnci/djq279; PMCID=PMC2935474 PubMed=22961666; DOI=10.1158/2159-8290.CD-12-0112; PMCID=PMC3567922 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=29681454; DOI=10.1016/j.cell.2018.03.028; PMCID=PMC5935540 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564; PMCID=PMC7496084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0037013
cancercelllines; CVCL_5136 Cell_Model_Passport; SIDM01610 DepMap; ACH-000872 IGRhCellID; HCC515_02v LINCS_LDP; LCL-2084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473216
BioSample; SAMN10989604 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4296203
ChEMBL-Targets; CHEMBL4296386 PharmacoDB; HCC515_506_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_5136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54881759 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0003135 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
GEO; GSM108879 GEO; GSM108880 GEO; GSM253364 GEO; GSM434263 GEO; GSM794381 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 877257
Cosmic; 903633 Cosmic; 1146939 Cosmic; 1239873 Cosmic; 1518097 Cosmic; 2125261 IARC_TP53; 28437 Progenetix; CVCL_5136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |