Cellosaurus HCC1359 (CVCL_5128)
Cell line name | HCC1359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HCC-1359; Hamon Cancer Center 1359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_5128 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HCC1359 (RRID:CVCL_5128) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: African American. Doubling time: 62.8 hours (PubMed=29681454). Omics: Deep exome analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Lung; UBERON=UBERON_0002048. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung giant cell carcinoma (NCIt: C4452) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 55Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): PubMed=20679594; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.utsouthwestern.edu/edumedia/edufiles/about_us/admin_offices/technology_development/available_technologies/cell-lines.pdf https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10353731 PubMed=20679594; DOI=10.1093/jnci/djq279; PMCID=PMC2935474 PubMed=22961666; DOI=10.1158/2159-8290.CD-12-0112; PMCID=PMC3567922 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=29681454; DOI=10.1016/j.cell.2018.03.028; PMCID=PMC5935540 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564; PMCID=PMC7496084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | KCLB; 71359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_5128
Cell_Model_Passport; SIDM01606 DepMap; ACH-000901 IGRhCellID; HCC1359GEO | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473015
BioSample; SAMN10987969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 666 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; HCC1359_448_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54881559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0003128 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM108861 GEO; GSM108862 GEO; GSM253422 GEO; GSM434259 GEO; GSM794387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1146926
IARC_TP53; 11449 LiGeA; CCLE_076 Progenetix; CVCL_5128 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 30-Jan-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 28 |