Cellosaurus SNU-620 (CVCL_5079)
Cell line name | SNU-620 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SNU620; NCI-SNU-620 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_5079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SNU-620 (RRID:CVCL_5079) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: Seoul National University (SNU) cell line collection. Part of: TCGA-110-CL cell line panel. Population: Korean. Characteristics: MET-amplified, contains 20-21 copies of the gene (PubMed=29435981). Doubling time: 31 hours (PubMed=29435981). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Ascites; UBERON=UBERON_0007795. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Gastric adenocarcinoma (NCIt: C4004) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 59Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): KCLB=00620; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9033653; DOI=10.1002/(SICI)1097-0215(19970207)70:4<443::AID-IJC12>3.0.CO;2-G PubMed=10812166; DOI=10.1016/S0165-4608(99)00217-4 PubMed=19956504; DOI=10.4143/crt.2005.37.1.1; PMCID=PMC2785416 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=24807215; DOI=10.1038/ncomms4830; PMCID=PMC4024760 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=29435981; DOI=10.1002/ijc.31304 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31395879; DOI=10.1038/s41467-019-11415-2; PMCID=PMC6687785 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | KCLB; 00620 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_5079
Cell_Model_Passport; SIDM01781 DepMap; ACH-000325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005171 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473178
BioSample; SAMN10987759 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; SNU620_1474_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54955229 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006757 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM887636 GEO; GSM888723 GEO; GSM1374895 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 685592
Cosmic; 848142 Cosmic; 921600 Cosmic; 1090456 Cosmic; 1528877 Cosmic; 2484958 Cosmic; 2807649 IARC_TP53; 30168 LiGeA; CCLE_322 Progenetix; CVCL_5079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 33 |