Cellosaurus SNU-520 (CVCL_5072)
Cell line name | SNU-520 | ||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SNU520; NCI-SNU-520 | ||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_5072 | ||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SNU-520 (RRID:CVCL_5072) | ||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: Seoul National University (SNU) cell line collection. Population: Korean. Microsatellite instability: Instable (MSI) (PubMed=31068700). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Stomach; UBERON=UBERON_0000945. | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Gastric adenocarcinoma (NCIt: C4004) | ||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 60Y | ||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): KCLB=00520 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9033653; DOI=10.1002/(SICI)1097-0215(19970207)70:4<443::AID-IJC12>3.0.CO;2-G PubMed=19956504; DOI=10.4143/crt.2005.37.1.1; PMCID=PMC2785416 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | KCLB; 00520 | ||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_5072
Cell_Model_Passport; SIDM01770 DepMap; ACH-000908 | ||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN10987747 | ||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; SNU520_1471_2019 | ||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54955217 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
GEO; GSM887633 GEO; GSM888719 | ||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 685591
Cosmic; 2373752 IARC_TP53; 30167 LiGeA; CCLE_828 Progenetix; CVCL_5072 | ||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||
Version number | 25 |