Cellosaurus U-CH2 (CVCL_4989)
Cell line name | U-CH2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | UCH-2; UCH2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_4989 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: U-CH2 (RRID:CVCL_4989) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: 4 days (PubMed=26183925); ~5-7 days (DSMZ=ACC-749); 3 days (Chordoma Foundation). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CNV analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: Chordoma Foundation
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Sacral chordoma (NCIt: C129927) Chordoma (ORDO: Orphanet_178) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 72Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-3218; Cosmic-CLP=1503373; DSMZ=ACC-749; PubMed=21253487; PubMed=26183925; PubMed=27102572; PubMed=28835717 Markers:
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Web pages | https://www.chordomafoundation.org/researchers/disease-models/u-ch2/ http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/UCH1_Crawford_protocol.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=21253487; DOI=10.1155/2010/630129; PMCID=PMC3022207 PubMed=26183925; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-14-3270 PubMed=27102572; DOI=10.1002/path.4729; PMCID=PMC4922416 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28515451; DOI=10.1038/s41598-017-02174-5; PMCID=PMC5435709 PubMed=28835717; DOI=10.1038/s41598-017-10044-3; PMCID=PMC5569021 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-3218
DSMZ; ACC-749 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | Cell_Model_Passport; SIDM01185
Cosmic-CLP; 1503373 DepMap; ACH-002204 DSMZCellDive; ACC-749 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; UCH2_1627_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54973617 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM1670565
GEO; GSM1673847 GEO; GSM1673848 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 2663858 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 29 |