Cellosaurus U-CH1 (CVCL_4988)
Cell line name | U-CH1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | UCH-1; UCH1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_4988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: U-CH1 (RRID:CVCL_4988) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Doubling time: ~1 week (Note=But can be significantly longer after recovery from liquid nitrogen freezing) (DSMZ=ACC-748); 2 days (PubMed=26183925); 9 days (Chordoma Foundation). Omics: CNV analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Bone, sacrum; UBERON=UBERON_0003690. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: Chordoma Foundation
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Disease | Sacral chordoma (NCIt: C129927) Chordoma (ORDO: Orphanet_178) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 56Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-3217; DSMZ=ACC-748; PubMed=21253487; PubMed=26183925; PubMed=27102572; PubMed=28835717 Markers:
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Web pages | https://www.chordomafoundation.org/researchers/disease-models/u-ch1/ http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/UCH1_Crawford_protocol.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=11579460; DOI=10.1002/gcc.1184 PubMed=20461036; DOI=10.1097/BRS.0b013e3181c2a8b0; PMCID=PMC3769690 PubMed=21253487; DOI=10.1155/2010/630129; PMCID=PMC3022207 PubMed=23325432; DOI=10.1101/gr.147942.112; PMCID=PMC3589544 PubMed=26183925; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-14-3270 PubMed=27102572; DOI=10.1002/path.4729; PMCID=PMC4922416 PubMed=28515451; DOI=10.1038/s41598-017-02174-5; PMCID=PMC5435709 PubMed=28606919; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-17-0177; PMCID=PMC5581713 PubMed=28835717; DOI=10.1038/s41598-017-10044-3; PMCID=PMC5569021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-3217
DSMZ; ACC-748 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_4988
DepMap; ACH-002335 DSMZCellDive; ACC-748 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | ENCODE; ENCBS267AAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1503374
PharmacoDB; UCH1_1626_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_4988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54973610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0004389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM1673845
GEO; GSM1673846 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 2663857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 33 |