Cellosaurus SUM44PE (CVCL_3424)
Cell line name | SUM44PE | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Sum44PE; SUM-44PE; SUM 44PE; SUM-44 PE; SUM-44; SUM 44; SUM44; Sum44; 44PE | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SUM44PE (RRID:CVCL_3424) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: JWGray breast cancer cell line panel. Characteristics: ER-positive, PR-negative and ERBB2-negative. Doubling time: 85.10 hours (JWGray panel). Omics: Array-based CGH. Omics: CNV analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: miRNA expression profiling. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=25960936
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Disease | Invasive breast lobular carcinoma (NCIt: C7950) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Age unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DepMap=ACH-001395 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://bioivt.com/sum-breast-cancer-cell-lines/ https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2346643/wiki/62255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8425198 PubMed=10424408; DOI=10.1023/A:1006135331912 PubMed=10604729; DOI=10.1038/sj.bjc.6695007; PMCID=PMC2362964 PubMed=10969801 PubMed=12353263; DOI=10.1002/gcc.10107 PubMed=12800145; DOI=10.1002/gcc.10218 PubMed=15677628; DOI=10.1093/carcin/bgi032 PubMed=16397213; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-05-2853 PubMed=16541312; DOI=10.1007/s10549-006-9186-z PubMed=17157791; DOI=10.1016/j.ccr.2006.10.008; PMCID=PMC2730521 PubMed=19582160; DOI=10.1371/journal.pone.0006146; PMCID=PMC2702084 PubMed=19593635; DOI=10.1007/s10549-009-0460-8 PubMed=23401782; DOI=10.1155/2013/872743; PMCID=PMC3562669 PubMed=23601657; DOI=10.1186/bcr3415; PMCID=PMC3672661 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110; PMCID=PMC3937590 PubMed=24425047; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-13-2779; PMCID=PMC3955299 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25757734; DOI=10.1186/s13058-015-0517-z; PMCID=PMC4320436 PubMed=30228172; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-1416; PMCID=PMC6507416 PubMed=32715085; DOI=10.1038/s41523-020-0173-z; PMCID=PMC7374090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_3424
Cell_Model_Passport; SIDM01835 DepMap; ACH-001395 LINCS_HMS; 51122 SLKBase; 219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; SUM44PE_1517_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54970850 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0001245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-TABM-157
ArrayExpress; E-TABM-244 GEO; GSM115108 GEO; GSM217603 GEO; GSM320179 GEO; GSM350531 GEO; GSM421886 GEO; GSM481300 GEO; GSM847438 GEO; GSM847505 GEO; GSM984233 GEO; GSM1053740 GEO; GSM1172997 GEO; GSM1226542 GEO; GSM1226543 GEO; GSM1226544 GEO; GSM1226545 GEO; GSM1226546 GEO; GSM1226547 GEO; GSM1226548 GEO; GSM1226549 GEO; GSM1226550 GEO; GSM1226551 GEO; GSM1226552 GEO; GSM1226553 GEO; GSM1226554 GEO; GSM1226555 GEO; GSM1226556 GEO; GSM1226557 GEO; GSM1226558 GEO; GSM1226559 GEO; GSM1226560 GEO; GSM1226561 GEO; GSM1661990 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 997937
Cosmic; 1289408 Cosmic; 1460237 IARC_TP53; 24364 Progenetix; CVCL_3424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 35 |