Cellosaurus OUMS-23 (CVCL_3088)
Cell line name | OUMS-23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | OUMS23; Okayama University Medical School-23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_3088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: OUMS-23 (RRID:CVCL_3088) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Population: Japanese. Doubling time: 50.2 hours (Note=In 1% FBS), 42.1 hours (Note=In 10% FBS) (PubMed=8576285); ~40 hours (Note=Lot 01262009), ~41 hours (Note=Lot 10232015) (JCRB=JCRB1022). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=25926053). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Pericardial effusion; UBERON=UBERON_0002409. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Colon carcinoma (NCIt: C4910) Familial adenomatous polyposis (NCIt: C3339) Familial adenomatous polyposis (ORDO: Orphanet_733) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 37Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): JCRB=JCRB1022; PubMed=25877200; PubMed=25926053 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8576285; DOI=10.1007/BF01226266 DOI=10.11418/jtca1981.16.3_173 PubMed=9359923; DOI=10.18926/AMO/30789 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=25926053; DOI=10.1038/ncomms8002 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | JCRB; JCRB1022
JCRB; NIHS0292 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009971
cancercelllines; CVCL_3088 Cell_Model_Passport; SIDM00036 ColonAtlas; OUMS23 DepMap; ACH-000296 LINCS_LDP; LCL-1165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470828
BioSample; SAMN03472537 BioSample; SAMN10987626 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1298363
PharmacoDB; OUMS23_1207_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54936768 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006717 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM827177 GEO; GSM887479 GEO; GSM888560 GEO; GSM1448077 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1187312
Cosmic; 1298363 IARC_TP53; 28324 LiGeA; CCLE_011 Progenetix; CVCL_3088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 35 |