Cellosaurus Fu97 (CVCL_2908)
Cell line name | Fu97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | FU97; FU-97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2908 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Fu97 (RRID:CVCL_2908) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Japanese. Characteristics: Produces high level of AFP. Doubling time: ~72 hours (PubMed=10614861); 30 hours (Note=Lot 08072007), ~34 hours (Note=Lot 02022011), ~31 hours (Note=Lot 03132015) (JCRB=JCRB1074). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Stomach; UBERON=UBERON_0000945. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Gastric adenocarcinoma (NCIt: C4004) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 66Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1290806; JCRB=JCRB1074; PubMed=25877200 Markers:
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Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10614861; DOI=10.1007/s11626-999-0090-9 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=24807215; DOI=10.1038/ncomms4830; PMCID=PMC4024760 PubMed=25343454; DOI=10.1371/journal.pone.0111146; PMCID=PMC4208810 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | JCRB; JCRB1074
JCRB; NIHS0332 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0037138
cancercelllines; CVCL_2908 Cell_Model_Passport; SIDM00503 Cosmic-CLP; 1290806 DepMap; ACH-000633 LINCS_HMS; 50013 LINCS_LDP; LCL-1894 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473260
BioSample; SAMN10987784 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1290806
PharmacoDB; FU97_371_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54835258 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002054 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM552357 GEO; GSM562400 GEO; GSM827164 GEO; GSM843502 GEO; GSM887013 GEO; GSM888082 GEO; GSM1237673 GEO; GSM1237698 GEO; GSM1669795 GEO; GSM2267426 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1187271
Cosmic; 1995407 Cosmic; 2807623 IARC_TP53; 28332 LiGeA; CCLE_657 Progenetix; CVCL_2908 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 33 |