Cellosaurus HRT-18 (CVCL_2514)
Cell line name | HRT-18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HRT18; Human Rectal Tumor-18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HRT-18 (RRID:CVCL_2514) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Population: Caucasian. Microsatellite instability: Instable (MSI) (PubMed=31068700). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Derived from site: In situ; Colon; UBERON=UBERON_0001155. Cell type: Epithelial cell of colon; CL=CL_0011108. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: CLS=300230
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Colon adenocarcinoma (NCIt: C4349) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_3449 (__Parent_cell_line_of_DLD-1/HCT 8/HCT 15/HRT-18) Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 67Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CCL-244; CLS=300230; ECACC=86040306; IZSLER=BS TCL 26 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=3349466 PubMed=9809040; DOI=10.1016/S0165-4608(98)00081-8 PubMed=12068308; DOI=10.1038/nature00766 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CCL-244
BCRJ; 0106 CCLV; CCLV-RIE 0108 CLS; 300230 ECACC; 86040306 IZSLER; BS TCL 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003668
CLO; CLO_0003836 CLDB; cl1710 CLDB; cl1711 cancercelllines; CVCL_2514 Cell_Model_Passport; SIDM00788 ColonAtlas; HRT18 DepMap; ACH-001091 LINCS_LDP; LCL-1289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001947 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471480
BioSample; SAMN10989582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308672
ChEMBL-Targets; CHEMBL614834 PharmacoDB; HRT18_567_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_2514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54895337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM827431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 724841
Progenetix; CVCL_2514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 32 |