Cellosaurus DND-41 (CVCL_2022)
Cell line name | DND-41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | DND 41; DND41; Dnd41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: DND-41 (RRID:CVCL_2022) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Population: Caucasian. Doubling time: ~35 hours (DSMZ=ACC-525). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=10739008; PubMed=11226526). Microsatellite instability: Instable (MSI-high) (PubMed=31068700; Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K79me2 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H4K20me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. Cell type: T-cell; CL=CL_0000084. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: DSMZCellDive=ACC-525
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Childhood T acute lymphoblastic leukemia (NCIt: C7953) Precursor T-cell acute lymphoblastic leukemia (ORDO: Orphanet_99861) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 13Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1297446; DSMZ=ACC-525 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://humantallcelllines.wordpress.com/comprehensivetable/dnd-41/ http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/Dnd41_Bernstein_protocol.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2985879; DOI=10.1016/0145-2126(85)90084-0 PubMed=3159941; DOI=10.1016/0145-2126(85)90134-1 PubMed=3874327; DOI=10.1016/0145-2126(85)90133-x PubMed=8127147 PubMed=8641406; DOI=10.1111/j.1600-0609.1996.tb00721.x PubMed=9933131; DOI=10.1016/S0145-2126(98)00133-7 PubMed=10071127; DOI=10.1016/S0145-2126(98)00146-5 PubMed=10739008; DOI=10.1016/S0145-2126(99)00182-4 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=11226526; DOI=10.1016/S0145-2126(00)00121-1 PubMed=15472075; DOI=10.1126/science.1102160 PubMed=17170727; DOI=10.1038/sj.leu.2404486 PubMed=17308084; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-06-2615 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=22675565; DOI=10.1371/journal.pone.0038463; PMCID=PMC3366948 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5; PMCID=PMC6167786 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x; PMCID=PMC6547646 PubMed=35354797; DOI=10.1038/s41467-022-29224-5; PMCID=PMC8967900 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-525
NCBI_Iran; C183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009834
cancercelllines; CVCL_2022 Cell_Model_Passport; SIDM00946 Cosmic-CLP; 1297446 DepMap; ACH-000981 DSMZCellDive; ACC-525 LINCS_LDP; LCL-1036 Lonza; 1410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473521
BioSample; SAMN10988451 ENCODE; ENCBS282AAA ENCODE; ENCBS439IWV ENCODE; ENCBS688JZQ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1297446
PharmacoDB; DND41_302_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54831320 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0007074 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
ArrayExpress; E-MTAB-3610 ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM886986 GEO; GSM888055 GEO; GSM1669739 GEO; GSM5137715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 721705
Cosmic; 801725 Cosmic; 913405 Cosmic; 933551 Cosmic; 944546 Cosmic; 998728 Cosmic; 1037686 Cosmic; 1115582 Cosmic; 1118466 Cosmic; 1151777 Cosmic; 1175127 Cosmic; 1224375 Cosmic; 1281366 Cosmic; 1330488 Cosmic; 1375579 Cosmic; 1524795 Cosmic; 1664514 Cosmic; 1641377 Cosmic; 1760521 Cosmic; 2165710 Cosmic; 2602912 IARC_TP53; 10567 LiGeA; CCLE_079 Progenetix; CVCL_2022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD023662
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 41 |