Cellosaurus COLO 849 (CVCL_2002)
Cell line name | COLO 849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | COLO-849; Colo 849; COLO #849; COLO849; Colorado 849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: COLO 849 (RRID:CVCL_2002) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Population: Caucasian. Doubling time: ~50-60 hours (DSMZ=ACC-216). Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Right axillary lymph node; UBERON=UBERON_0001097. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Cutaneous melanoma (NCIt: C3510) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_1137 ! COLO 829 CVCL_1999 ! COLO 829BL CVCL_L503 ! COLO 831 CVCL_2000 ! COLO 832 CVCL_L504 ! COLO 833 CVCL_L505 ! COLO 834 CVCL_L506 ! COLO 835 CVCL_L507 ! COLO 838 CVCL_2001 ! COLO 839 CVCL_L508 ! COLO 845 CVCL_L509 ! COLO 848 CVCL_2003 ! COLO 853 CVCL_2004 ! COLO 857 CVCL_2005 ! COLO 858 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 43Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DSMZ=ACC-216; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8402545; DOI=10.1016/0165-4608(93)90083-X PubMed=7780963 PubMed=11668190; DOI=10.1177/002215540104901105 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002578
CLDB; cl872 cancercelllines; CVCL_2002 Cell_Model_Passport; SIDM01870 DepMap; ACH-001045 DSMZCellDive; ACC-216 LINCS_LDP; LCL-1245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473234 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; COLO849_239_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54814168 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
GEO; GSM886954 GEO; GSM888022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 888062
IARC_TP53; 21247 Progenetix; CVCL_2002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 32 |