Cellosaurus OCI-Ly7 (CVCL_1881)
Cell line name | OCI-Ly7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | OCI-LY7; OCI-LY-7; OCI-Ly-7; Oci-Ly-7; OCI-Ly 7; OCI-Ly07; OCILY7; Ly7; LY7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: OCI-Ly7 (RRID:CVCL_1881) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. From: Ontario Cancer Institute (OCI); Toronto; Canada. Population: Caucasian. Characteristics: Genetically heterogeneous, consists of 2 subclones (PubMed=27566572). Doubling time: ~20-24 hours (DSMZ=ACC-688). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: CNV analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: H3K9ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: miRNA expression profiling. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=25960936
Source: DSMZCellDive=ACC-688
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Diffuse large B-cell lymphoma germinal center B-cell type (NCIt: C36080) Diffuse large B-cell lymphoma (ORDO: Orphanet_544) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 48Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1659819; DepMap=ACH-001617; DSMZ=ACC-688 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.innovationbridge.com/uhn/diffuse-large-b-cell-lymphoma-cell-lines?categories=32&communities=5&forums=&organizations=&tags= https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=3567358; DOI=10.1182/blood.V69.5.1307.1307 PubMed=8574164; DOI=10.3109/10428199509059672 PubMed=11807979; DOI=10.1002/gcc.10025 PubMed=15126345; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-03-3773 PubMed=19278952; DOI=10.1182/blood-2009-01-202028; PMCID=PMC3401058 PubMed=19358282; DOI=10.1002/ijc.24351 PubMed=20054396; DOI=10.1038/nature08638; PMCID=PMC2845535 PubMed=20628145; DOI=10.1182/blood-2010-05-282780; PMCID=PMC2995356 PubMed=23257783; DOI=10.1038/leu.2012.367 PubMed=23292937; DOI=10.1073/pnas.1205299110; PMCID=PMC3557051 PubMed=23699601; DOI=10.1182/blood-2013-02-483727; PMCID=PMC3744992 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=27566572; DOI=10.18632/oncotarget.11524; PMCID=PMC5325377 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x; PMCID=PMC6547646 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-688 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_1881
Cell_Model_Passport; SIDM00459 Cosmic-CLP; 1659819 DepMap; ACH-001617 DSMZCellDive; ACC-688 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0006414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473439
ENCODE; ENCBS006VZG ENCODE; ENCBS040MJM ENCODE; ENCBS062JSC ENCODE; ENCBS121JKZ ENCODE; ENCBS141AMI ENCODE; ENCBS182NFY ENCODE; ENCBS304FAI ENCODE; ENCBS581USS ENCODE; ENCBS699NWP ENCODE; ENCBS865AAA ENCODE; ENCBS866AAA ENCODE; ENCBS886BJZ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 1398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4523533
ChEMBL-Targets; CHEMBL4523564 GDSC; 1659819 PharmacoDB; OCILY7_1187_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54931777 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006711 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-3610 ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM380135 GEO; GSM552453 GEO; GSM562825 GEO; GSM1035333 GEO; GSM1059809 GEO; GSM1374789 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1329092
Cosmic; 1517649 Cosmic; 1541903 Cosmic; 1629934 Cosmic; 1945199 Cosmic; 2276331 Progenetix; CVCL_1881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 41 |