Cellosaurus KOPN-8 (CVCL_1866)
Cell line name | KOPN-8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Kopn-8; KOPN8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: KOPN-8 (RRID:CVCL_1866) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Japanese. Doubling time: ~48 hours (DSMZ=ACC-552). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
Source: DSMZCellDive=ACC-552
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Childhood B acute lymphoblastic leukemia (NCIt: C9140) B acute lymphoblastic leukemia with t(v;11q23.3) MLL rearranged (NCIt: C80342) B-lymphoblastic leukemia/lymphoma with t(v;11q23.3) (ORDO: Orphanet_585918) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 3M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1330933; DSMZ=ACC-552 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2985879; DOI=10.1016/0145-2126(85)90084-0 PubMed=3159941; DOI=10.1016/0145-2126(85)90134-1 PubMed=3874327; DOI=10.1016/0145-2126(85)90133-x PubMed=9067587; DOI=10.1038/sj.leu.2400571 PubMed=9680106; DOI=10.1016/S0145-2126(98)00050-2 PubMed=10233379; DOI=10.1111/j.1365-2141.1999.01284.x DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=14671638; DOI=10.1038/sj.leu.2403236 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5; PMCID=PMC6167786 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404; PMCID=PMC6328144 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x; PMCID=PMC6547646 PubMed=35354797; DOI=10.1038/s41467-022-29224-5; PMCID=PMC8967900 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0037178
cancercelllines; CVCL_1866 Cell_Model_Passport; SIDM01034 Cosmic-CLP; 1330933 DepMap; ACH-001106 DSMZCellDive; ACC-552 LINCS_LDP; LCL-1088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473535
BioSample; SAMN10988515 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4295381
ChEMBL-Targets; CHEMBL4296456 GDSC; 1330933 PharmacoDB; KOPN8_779_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54900325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0022428 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
ArrayExpress; E-MTAB-3610 ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM887234 GEO; GSM888308 GEO; GSM1670000 GEO; GSM5137722 GEO; GSM5137766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 998710
Cosmic; 999747 Cosmic; 1037722 Cosmic; 1130256 Cosmic; 1191708 Cosmic; 2491068 Cosmic; 2542838 IARC_TP53; 28230 LiGeA; CCLE_069 Progenetix; CVCL_1866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD023662
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 37 |