Cellosaurus YT (CVCL_1797)
Cell line name | YT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | YT-0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: YT (RRID:CVCL_1797) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Population: Japanese. Doubling time: ~40-50 hours (DSMZ=ACC-434). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Transformant: NCBI_TaxID; 10376; Epstein-Barr virus (EBV). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Pericardial effusion; UBERON=UBERON_0002409. Cell type: Natural killer cell; CL=CL_0000623. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: DSMZCellDive=ACC-434
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Natural killer cell lymphoblastic leukemia/lymphoma (NCIt: C82217) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 15Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=946358; DSMZ=ACC-434 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | http://www.cells-talk.com/index.php/page/copelibrary?key=YT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2578514; DOI=10.4049/jimmunol.134.3.1623 PubMed=3098894; DOI=10.1084/jem.165.1.223; PMCID=PMC2188268 PubMed=1313126 PubMed=9787181; DOI=10.1182/blood.V92.9.3410 PubMed=10803505; DOI=10.1038/sj.leu.2401778 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=16408098; DOI=10.1038/sj.leu.2404081 PubMed=16827800; DOI=10.1111/j.1349-7006.2006.00226.x; PMCID=PMC11159954 PubMed=19194464; DOI=10.1038/leu.2009.3 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20454443; DOI=10.1155/2010/904767; PMCID=PMC2861168 PubMed=21052088; DOI=10.1038/leu.2010.255 PubMed=25586472; DOI=10.1038/ncomms7025; PMCID=PMC7743911 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x; PMCID=PMC6547646 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009718
Cell_Model_Passport; SIDM00410 Cosmic-CLP; 946358 DepMap; ACH-002317 DSMZCellDive; ACC-434 LINCS_LDP; LCL-1913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005228 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473541 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308146
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366114 GDSC; 946358 PharmacoDB; YT_1688_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54995532 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0022423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-3610
ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM236811 GEO; GSM236847 GEO; GSM472010 GEO; GSM1670588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 850219
Cosmic; 946358 Cosmic; 991546 Cosmic; 1012130 Cosmic; 1524828 Cosmic; 1542072 Cosmic; 2390120 Cosmic; 2785211 IARC_TP53; 27711 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 35 |